Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM2

Kdelr2, ER lumen protein-retaining receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr2Q9CQM2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdelr2Q9CQM2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdelr2Q9CQM2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdelr2Q9CQM2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdelr2Q9CQM2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdelr2Q9CQM2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdelr2Q9CQM2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdelr2Q9CQM2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdelr2Q9CQM2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdelr2Q9CQM2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kdelr2Q9CQM2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdelr2Q9CQM2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdelr2Q9CQM2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdelr2Q9CQM2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdelr2Q9CQM2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdelr2Q9CQM2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdelr2Q9CQM2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdelr2Q9CQM2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdelr2Q9CQM2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdelr2Q9CQM2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdelr2Q9CQM2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdelr2Q9CQM2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdelr2Q9CQM2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdelr2Q9CQM2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdelr2Q9CQM2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdelr2Q9CQM2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdelr2Q9CQM2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdelr2Q9CQM2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdelr2Q9CQM2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdelr2Q9CQM2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdelr2Q9CQM2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdelr2Q9CQM2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdelr2Q9CQM2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdelr2Q9CQM2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdelr2Q9CQM2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdelr2Q9CQM2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdelr2Q9CQM2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdelr2Q9CQM2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdelr2Q9CQM2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdelr2Q9CQM2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdelr2Q9CQM2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdelr2Q9CQM2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdelr2Q9CQM2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdelr2Q9CQM2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdelr2Q9CQM2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdelr2Q9CQM2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdelr2Q9CQM2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdelr2Q9CQM2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdelr2Q9CQM2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdelr2Q9CQM2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdelr2Q9CQM2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdelr2Q9CQM2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdelr2Q9CQM2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdelr2Q9CQM2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdelr2Q9CQM2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdelr2Q9CQM2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdelr2Q9CQM2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdelr2Q9CQM2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdelr2Q9CQM2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdelr2Q9CQM2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdelr2Q9CQM2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdelr2Q9CQM2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdelr2Q9CQM2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdelr2Q9CQM2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdelr2Q9CQM2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdelr2Q9CQM2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdelr2Q9CQM2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdelr2Q9CQM2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdelr2Q9CQM2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdelr2Q9CQM2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdelr2Q9CQM2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdelr2Q9CQM2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdelr2Q9CQM2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdelr2Q9CQM2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdelr2Q9CQM2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdelr2Q9CQM2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdelr2Q9CQM2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdelr2Q9CQM2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdelr2Q9CQM2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdelr2Q9CQM2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdelr2Q9CQM2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdelr2Q9CQM2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdelr2Q9CQM2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdelr2Q9CQM2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdelr2Q9CQM2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdelr2Q9CQM2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdelr2Q9CQM2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdelr2Q9CQM2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdelr2Q9CQM2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdelr2Q9CQM2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdelr2Q9CQM2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdelr2Q9CQM2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdelr2Q9CQM2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdelr2Q9CQM2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdelr2Q9CQM2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdelr2Q9CQM2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdelr2Q9CQM2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdelr2Q9CQM2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdelr2Q9CQM2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdelr2Q9CQM2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms