Protein–RNA interactions for Protein: Q99M03

Rwdd2b, RWD domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd2bQ99M03 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rwdd2bQ99M03 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rwdd2bQ99M03 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rwdd2bQ99M03 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rwdd2bQ99M03 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rwdd2bQ99M03 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rwdd2bQ99M03 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rwdd2bQ99M03 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rwdd2bQ99M03 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rwdd2bQ99M03 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rwdd2bQ99M03 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rwdd2bQ99M03 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rwdd2bQ99M03 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rwdd2bQ99M03 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rwdd2bQ99M03 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rwdd2bQ99M03 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rwdd2bQ99M03 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rwdd2bQ99M03 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rwdd2bQ99M03 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rwdd2bQ99M03 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rwdd2bQ99M03 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rwdd2bQ99M03 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rwdd2bQ99M03 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rwdd2bQ99M03 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rwdd2bQ99M03 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rwdd2bQ99M03 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rwdd2bQ99M03 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Rwdd2bQ99M03 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rwdd2bQ99M03 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rwdd2bQ99M03 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rwdd2bQ99M03 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rwdd2bQ99M03 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rwdd2bQ99M03 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rwdd2bQ99M03 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rwdd2bQ99M03 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rwdd2bQ99M03 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rwdd2bQ99M03 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rwdd2bQ99M03 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rwdd2bQ99M03 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rwdd2bQ99M03 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rwdd2bQ99M03 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rwdd2bQ99M03 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rwdd2bQ99M03 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rwdd2bQ99M03 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rwdd2bQ99M03 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rwdd2bQ99M03 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rwdd2bQ99M03 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rwdd2bQ99M03 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rwdd2bQ99M03 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rwdd2bQ99M03 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rwdd2bQ99M03 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rwdd2bQ99M03 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rwdd2bQ99M03 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rwdd2bQ99M03 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rwdd2bQ99M03 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rwdd2bQ99M03 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rwdd2bQ99M03 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rwdd2bQ99M03 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rwdd2bQ99M03 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rwdd2bQ99M03 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rwdd2bQ99M03 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rwdd2bQ99M03 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rwdd2bQ99M03 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rwdd2bQ99M03 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rwdd2bQ99M03 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rwdd2bQ99M03 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rwdd2bQ99M03 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rwdd2bQ99M03 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rwdd2bQ99M03 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rwdd2bQ99M03 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rwdd2bQ99M03 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rwdd2bQ99M03 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rwdd2bQ99M03 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rwdd2bQ99M03 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rwdd2bQ99M03 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rwdd2bQ99M03 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rwdd2bQ99M03 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rwdd2bQ99M03 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rwdd2bQ99M03 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rwdd2bQ99M03 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rwdd2bQ99M03 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rwdd2bQ99M03 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rwdd2bQ99M03 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rwdd2bQ99M03 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rwdd2bQ99M03 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rwdd2bQ99M03 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rwdd2bQ99M03 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rwdd2bQ99M03 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rwdd2bQ99M03 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rwdd2bQ99M03 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rwdd2bQ99M03 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rwdd2bQ99M03 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rwdd2bQ99M03 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rwdd2bQ99M03 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rwdd2bQ99M03 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rwdd2bQ99M03 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rwdd2bQ99M03 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rwdd2bQ99M03 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rwdd2bQ99M03 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rwdd2bQ99M03 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms