Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cstf3Q99LI7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cstf3Q99LI7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cstf3Q99LI7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cstf3Q99LI7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cstf3Q99LI7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cstf3Q99LI7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cstf3Q99LI7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cstf3Q99LI7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cstf3Q99LI7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cstf3Q99LI7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cstf3Q99LI7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cstf3Q99LI7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cstf3Q99LI7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cstf3Q99LI7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cstf3Q99LI7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cstf3Q99LI7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cstf3Q99LI7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cstf3Q99LI7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cstf3Q99LI7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cstf3Q99LI7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cstf3Q99LI7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cstf3Q99LI7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cstf3Q99LI7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cstf3Q99LI7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cstf3Q99LI7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cstf3Q99LI7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cstf3Q99LI7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cstf3Q99LI7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cstf3Q99LI7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cstf3Q99LI7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cstf3Q99LI7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cstf3Q99LI7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cstf3Q99LI7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cstf3Q99LI7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cstf3Q99LI7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cstf3Q99LI7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cstf3Q99LI7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cstf3Q99LI7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cstf3Q99LI7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cstf3Q99LI7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cstf3Q99LI7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cstf3Q99LI7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cstf3Q99LI7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cstf3Q99LI7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cstf3Q99LI7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cstf3Q99LI7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cstf3Q99LI7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cstf3Q99LI7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cstf3Q99LI7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cstf3Q99LI7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cstf3Q99LI7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cstf3Q99LI7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cstf3Q99LI7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cstf3Q99LI7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cstf3Q99LI7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cstf3Q99LI7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cstf3Q99LI7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cstf3Q99LI7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cstf3Q99LI7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cstf3Q99LI7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cstf3Q99LI7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cstf3Q99LI7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cstf3Q99LI7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cstf3Q99LI7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cstf3Q99LI7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cstf3Q99LI7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cstf3Q99LI7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cstf3Q99LI7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cstf3Q99LI7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cstf3Q99LI7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cstf3Q99LI7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cstf3Q99LI7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cstf3Q99LI7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cstf3Q99LI7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cstf3Q99LI7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cstf3Q99LI7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cstf3Q99LI7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cstf3Q99LI7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cstf3Q99LI7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cstf3Q99LI7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cstf3Q99LI7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cstf3Q99LI7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cstf3Q99LI7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cstf3Q99LI7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cstf3Q99LI7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cstf3Q99LI7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cstf3Q99LI7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cstf3Q99LI7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cstf3Q99LI7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cstf3Q99LI7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cstf3Q99LI7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cstf3Q99LI7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cstf3Q99LI7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cstf3Q99LI7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cstf3Q99LI7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cstf3Q99LI7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cstf3Q99LI7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cstf3Q99LI7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cstf3Q99LI7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms