Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX1

Taf11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf11Q99JX1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Taf11Q99JX1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Taf11Q99JX1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Taf11Q99JX1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Taf11Q99JX1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Taf11Q99JX1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Taf11Q99JX1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Taf11Q99JX1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf11Q99JX1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf11Q99JX1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf11Q99JX1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf11Q99JX1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf11Q99JX1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf11Q99JX1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf11Q99JX1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf11Q99JX1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf11Q99JX1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf11Q99JX1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf11Q99JX1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf11Q99JX1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf11Q99JX1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf11Q99JX1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf11Q99JX1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf11Q99JX1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf11Q99JX1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf11Q99JX1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf11Q99JX1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf11Q99JX1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf11Q99JX1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf11Q99JX1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf11Q99JX1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf11Q99JX1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf11Q99JX1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf11Q99JX1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf11Q99JX1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf11Q99JX1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf11Q99JX1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf11Q99JX1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf11Q99JX1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf11Q99JX1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf11Q99JX1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Taf11Q99JX1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf11Q99JX1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf11Q99JX1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf11Q99JX1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf11Q99JX1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf11Q99JX1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf11Q99JX1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf11Q99JX1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf11Q99JX1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf11Q99JX1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf11Q99JX1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Taf11Q99JX1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Taf11Q99JX1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Taf11Q99JX1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf11Q99JX1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf11Q99JX1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf11Q99JX1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf11Q99JX1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf11Q99JX1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf11Q99JX1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf11Q99JX1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Taf11Q99JX1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Taf11Q99JX1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Taf11Q99JX1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Taf11Q99JX1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Taf11Q99JX1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf11Q99JX1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf11Q99JX1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf11Q99JX1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf11Q99JX1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf11Q99JX1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf11Q99JX1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf11Q99JX1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf11Q99JX1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf11Q99JX1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf11Q99JX1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf11Q99JX1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf11Q99JX1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf11Q99JX1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf11Q99JX1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf11Q99JX1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf11Q99JX1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf11Q99JX1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Taf11Q99JX1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Taf11Q99JX1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Taf11Q99JX1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Taf11Q99JX1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf11Q99JX1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf11Q99JX1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf11Q99JX1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf11Q99JX1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf11Q99JX1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf11Q99JX1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf11Q99JX1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf11Q99JX1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf11Q99JX1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf11Q99JX1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf11Q99JX1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf11Q99JX1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.3 ms