Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ3

Thyn1, Thymocyte nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thyn1Q91YJ3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Thyn1Q91YJ3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Thyn1Q91YJ3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Thyn1Q91YJ3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Thyn1Q91YJ3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Thyn1Q91YJ3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Thyn1Q91YJ3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Thyn1Q91YJ3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Thyn1Q91YJ3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Thyn1Q91YJ3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Thyn1Q91YJ3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Thyn1Q91YJ3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Thyn1Q91YJ3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Thyn1Q91YJ3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Thyn1Q91YJ3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Thyn1Q91YJ3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Thyn1Q91YJ3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Thyn1Q91YJ3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Thyn1Q91YJ3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Thyn1Q91YJ3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Thyn1Q91YJ3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thyn1Q91YJ3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thyn1Q91YJ3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thyn1Q91YJ3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thyn1Q91YJ3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thyn1Q91YJ3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Thyn1Q91YJ3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thyn1Q91YJ3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thyn1Q91YJ3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thyn1Q91YJ3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Thyn1Q91YJ3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Thyn1Q91YJ3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Thyn1Q91YJ3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Thyn1Q91YJ3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Thyn1Q91YJ3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Thyn1Q91YJ3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Thyn1Q91YJ3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Thyn1Q91YJ3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Thyn1Q91YJ3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Thyn1Q91YJ3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Thyn1Q91YJ3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Thyn1Q91YJ3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Thyn1Q91YJ3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Thyn1Q91YJ3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Thyn1Q91YJ3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Thyn1Q91YJ3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thyn1Q91YJ3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thyn1Q91YJ3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thyn1Q91YJ3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thyn1Q91YJ3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Thyn1Q91YJ3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Thyn1Q91YJ3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Thyn1Q91YJ3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Thyn1Q91YJ3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Thyn1Q91YJ3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Thyn1Q91YJ3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Thyn1Q91YJ3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Thyn1Q91YJ3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Thyn1Q91YJ3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Thyn1Q91YJ3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Thyn1Q91YJ3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Thyn1Q91YJ3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Thyn1Q91YJ3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Thyn1Q91YJ3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Thyn1Q91YJ3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Thyn1Q91YJ3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Thyn1Q91YJ3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Thyn1Q91YJ3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Thyn1Q91YJ3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Thyn1Q91YJ3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Thyn1Q91YJ3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Thyn1Q91YJ3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Thyn1Q91YJ3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Thyn1Q91YJ3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Thyn1Q91YJ3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Thyn1Q91YJ3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Thyn1Q91YJ3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Thyn1Q91YJ3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Thyn1Q91YJ3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Thyn1Q91YJ3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Thyn1Q91YJ3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Thyn1Q91YJ3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Thyn1Q91YJ3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Thyn1Q91YJ3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Thyn1Q91YJ3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Thyn1Q91YJ3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Thyn1Q91YJ3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Thyn1Q91YJ3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Thyn1Q91YJ3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Thyn1Q91YJ3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Thyn1Q91YJ3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Thyn1Q91YJ3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Thyn1Q91YJ3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Thyn1Q91YJ3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Thyn1Q91YJ3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Thyn1Q91YJ3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Thyn1Q91YJ3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Thyn1Q91YJ3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Thyn1Q91YJ3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Thyn1Q91YJ3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms