Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y14

Pcdha6, Pcdha6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha6Q91Y14 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdha6Q91Y14 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdha6Q91Y14 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdha6Q91Y14 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdha6Q91Y14 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdha6Q91Y14 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdha6Q91Y14 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdha6Q91Y14 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdha6Q91Y14 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdha6Q91Y14 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdha6Q91Y14 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdha6Q91Y14 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdha6Q91Y14 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdha6Q91Y14 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcdha6Q91Y14 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcdha6Q91Y14 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcdha6Q91Y14 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcdha6Q91Y14 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcdha6Q91Y14 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcdha6Q91Y14 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcdha6Q91Y14 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcdha6Q91Y14 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcdha6Q91Y14 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcdha6Q91Y14 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcdha6Q91Y14 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcdha6Q91Y14 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcdha6Q91Y14 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcdha6Q91Y14 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcdha6Q91Y14 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcdha6Q91Y14 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcdha6Q91Y14 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcdha6Q91Y14 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcdha6Q91Y14 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcdha6Q91Y14 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcdha6Q91Y14 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcdha6Q91Y14 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcdha6Q91Y14 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcdha6Q91Y14 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdha6Q91Y14 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdha6Q91Y14 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdha6Q91Y14 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdha6Q91Y14 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdha6Q91Y14 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdha6Q91Y14 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdha6Q91Y14 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdha6Q91Y14 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdha6Q91Y14 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdha6Q91Y14 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdha6Q91Y14 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdha6Q91Y14 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdha6Q91Y14 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdha6Q91Y14 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdha6Q91Y14 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdha6Q91Y14 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdha6Q91Y14 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdha6Q91Y14 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdha6Q91Y14 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdha6Q91Y14 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdha6Q91Y14 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdha6Q91Y14 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdha6Q91Y14 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdha6Q91Y14 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdha6Q91Y14 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdha6Q91Y14 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdha6Q91Y14 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdha6Q91Y14 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdha6Q91Y14 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdha6Q91Y14 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdha6Q91Y14 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdha6Q91Y14 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdha6Q91Y14 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdha6Q91Y14 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdha6Q91Y14 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha6Q91Y14 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha6Q91Y14 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha6Q91Y14 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdha6Q91Y14 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha6Q91Y14 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha6Q91Y14 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha6Q91Y14 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha6Q91Y14 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha6Q91Y14 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdha6Q91Y14 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdha6Q91Y14 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdha6Q91Y14 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdha6Q91Y14 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdha6Q91Y14 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdha6Q91Y14 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdha6Q91Y14 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdha6Q91Y14 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdha6Q91Y14 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdha6Q91Y14 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdha6Q91Y14 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdha6Q91Y14 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdha6Q91Y14 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdha6Q91Y14 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdha6Q91Y14 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdha6Q91Y14 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdha6Q91Y14 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdha6Q91Y14 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms