Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Odf4Q8VI88 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Odf4Q8VI88 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odf4Q8VI88 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odf4Q8VI88 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odf4Q8VI88 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odf4Q8VI88 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odf4Q8VI88 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odf4Q8VI88 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odf4Q8VI88 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Odf4Q8VI88 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf4Q8VI88 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf4Q8VI88 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf4Q8VI88 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf4Q8VI88 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf4Q8VI88 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf4Q8VI88 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Odf4Q8VI88 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Odf4Q8VI88 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odf4Q8VI88 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odf4Q8VI88 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Odf4Q8VI88 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Odf4Q8VI88 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Odf4Q8VI88 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Odf4Q8VI88 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Odf4Q8VI88 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Odf4Q8VI88 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odf4Q8VI88 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odf4Q8VI88 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odf4Q8VI88 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Odf4Q8VI88 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Odf4Q8VI88 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Odf4Q8VI88 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Odf4Q8VI88 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Odf4Q8VI88 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Odf4Q8VI88 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Odf4Q8VI88 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odf4Q8VI88 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odf4Q8VI88 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odf4Q8VI88 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odf4Q8VI88 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odf4Q8VI88 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odf4Q8VI88 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odf4Q8VI88 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odf4Q8VI88 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odf4Q8VI88 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odf4Q8VI88 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odf4Q8VI88 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odf4Q8VI88 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odf4Q8VI88 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odf4Q8VI88 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odf4Q8VI88 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Odf4Q8VI88 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Odf4Q8VI88 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Odf4Q8VI88 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Odf4Q8VI88 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Odf4Q8VI88 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Odf4Q8VI88 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Odf4Q8VI88 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Odf4Q8VI88 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Odf4Q8VI88 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Odf4Q8VI88 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Odf4Q8VI88 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Odf4Q8VI88 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Odf4Q8VI88 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Odf4Q8VI88 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Odf4Q8VI88 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Odf4Q8VI88 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Odf4Q8VI88 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Odf4Q8VI88 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Odf4Q8VI88 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Odf4Q8VI88 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Odf4Q8VI88 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Odf4Q8VI88 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Odf4Q8VI88 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Odf4Q8VI88 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Odf4Q8VI88 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Odf4Q8VI88 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Odf4Q8VI88 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Odf4Q8VI88 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Odf4Q8VI88 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Odf4Q8VI88 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Odf4Q8VI88 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Odf4Q8VI88 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Odf4Q8VI88 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Odf4Q8VI88 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Odf4Q8VI88 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Odf4Q8VI88 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Odf4Q8VI88 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Odf4Q8VI88 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Odf4Q8VI88 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Odf4Q8VI88 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Odf4Q8VI88 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Odf4Q8VI88 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Odf4Q8VI88 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Odf4Q8VI88 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Odf4Q8VI88 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Odf4Q8VI88 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Odf4Q8VI88 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Odf4Q8VI88 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms