Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE11

Mtmr6, Myotubularin-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr6Q8VE11 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mtmr6Q8VE11 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mtmr6Q8VE11 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mtmr6Q8VE11 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mtmr6Q8VE11 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mtmr6Q8VE11 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mtmr6Q8VE11 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mtmr6Q8VE11 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mtmr6Q8VE11 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mtmr6Q8VE11 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mtmr6Q8VE11 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mtmr6Q8VE11 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mtmr6Q8VE11 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mtmr6Q8VE11 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Mtmr6Q8VE11 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mtmr6Q8VE11 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mtmr6Q8VE11 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mtmr6Q8VE11 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mtmr6Q8VE11 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mtmr6Q8VE11 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mtmr6Q8VE11 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mtmr6Q8VE11 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mtmr6Q8VE11 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mtmr6Q8VE11 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mtmr6Q8VE11 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mtmr6Q8VE11 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mtmr6Q8VE11 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Mtmr6Q8VE11 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mtmr6Q8VE11 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Mtmr6Q8VE11 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mtmr6Q8VE11 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mtmr6Q8VE11 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mtmr6Q8VE11 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mtmr6Q8VE11 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mtmr6Q8VE11 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mtmr6Q8VE11 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mtmr6Q8VE11 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mtmr6Q8VE11 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mtmr6Q8VE11 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mtmr6Q8VE11 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mtmr6Q8VE11 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mtmr6Q8VE11 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mtmr6Q8VE11 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mtmr6Q8VE11 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mtmr6Q8VE11 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mtmr6Q8VE11 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mtmr6Q8VE11 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Mtmr6Q8VE11 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mtmr6Q8VE11 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mtmr6Q8VE11 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mtmr6Q8VE11 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mtmr6Q8VE11 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mtmr6Q8VE11 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mtmr6Q8VE11 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mtmr6Q8VE11 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mtmr6Q8VE11 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mtmr6Q8VE11 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Mtmr6Q8VE11 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mtmr6Q8VE11 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mtmr6Q8VE11 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mtmr6Q8VE11 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Mtmr6Q8VE11 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mtmr6Q8VE11 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mtmr6Q8VE11 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mtmr6Q8VE11 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mtmr6Q8VE11 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mtmr6Q8VE11 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mtmr6Q8VE11 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mtmr6Q8VE11 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mtmr6Q8VE11 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mtmr6Q8VE11 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mtmr6Q8VE11 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mtmr6Q8VE11 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mtmr6Q8VE11 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mtmr6Q8VE11 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mtmr6Q8VE11 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mtmr6Q8VE11 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mtmr6Q8VE11 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mtmr6Q8VE11 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mtmr6Q8VE11 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Mtmr6Q8VE11 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mtmr6Q8VE11 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mtmr6Q8VE11 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mtmr6Q8VE11 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mtmr6Q8VE11 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mtmr6Q8VE11 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Mtmr6Q8VE11 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mtmr6Q8VE11 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mtmr6Q8VE11 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mtmr6Q8VE11 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mtmr6Q8VE11 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Mtmr6Q8VE11 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Mtmr6Q8VE11 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Mtmr6Q8VE11 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Mtmr6Q8VE11 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mtmr6Q8VE11 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mtmr6Q8VE11 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mtmr6Q8VE11 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mtmr6Q8VE11 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mtmr6Q8VE11 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms