Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDT9

Mrpl50, 39S ribosomal protein L50, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl50Q8VDT9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mrpl50Q8VDT9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Mrpl50Q8VDT9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Mrpl50Q8VDT9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mrpl50Q8VDT9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mrpl50Q8VDT9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mrpl50Q8VDT9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mrpl50Q8VDT9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Mrpl50Q8VDT9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Mrpl50Q8VDT9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Mrpl50Q8VDT9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Mrpl50Q8VDT9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Mrpl50Q8VDT9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Mrpl50Q8VDT9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Mrpl50Q8VDT9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Mrpl50Q8VDT9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Mrpl50Q8VDT9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Mrpl50Q8VDT9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Mrpl50Q8VDT9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Mrpl50Q8VDT9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mrpl50Q8VDT9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mrpl50Q8VDT9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mrpl50Q8VDT9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Mrpl50Q8VDT9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Mrpl50Q8VDT9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mrpl50Q8VDT9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mrpl50Q8VDT9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mrpl50Q8VDT9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Mrpl50Q8VDT9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Mrpl50Q8VDT9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Mrpl50Q8VDT9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Mrpl50Q8VDT9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Mrpl50Q8VDT9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Mrpl50Q8VDT9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Mrpl50Q8VDT9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Mrpl50Q8VDT9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Mrpl50Q8VDT9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Mrpl50Q8VDT9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Mrpl50Q8VDT9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mrpl50Q8VDT9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mrpl50Q8VDT9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mrpl50Q8VDT9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Mrpl50Q8VDT9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Mrpl50Q8VDT9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Mrpl50Q8VDT9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Mrpl50Q8VDT9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Mrpl50Q8VDT9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Mrpl50Q8VDT9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Mrpl50Q8VDT9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Mrpl50Q8VDT9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Mrpl50Q8VDT9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Mrpl50Q8VDT9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mrpl50Q8VDT9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mrpl50Q8VDT9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mrpl50Q8VDT9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Mrpl50Q8VDT9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Mrpl50Q8VDT9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mrpl50Q8VDT9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mrpl50Q8VDT9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mrpl50Q8VDT9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mrpl50Q8VDT9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mrpl50Q8VDT9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mrpl50Q8VDT9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mrpl50Q8VDT9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mrpl50Q8VDT9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mrpl50Q8VDT9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mrpl50Q8VDT9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mrpl50Q8VDT9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mrpl50Q8VDT9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Mrpl50Q8VDT9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mrpl50Q8VDT9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Mrpl50Q8VDT9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mrpl50Q8VDT9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mrpl50Q8VDT9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mrpl50Q8VDT9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mrpl50Q8VDT9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mrpl50Q8VDT9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mrpl50Q8VDT9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Mrpl50Q8VDT9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mrpl50Q8VDT9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mrpl50Q8VDT9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mrpl50Q8VDT9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mrpl50Q8VDT9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mrpl50Q8VDT9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mrpl50Q8VDT9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Mrpl50Q8VDT9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Mrpl50Q8VDT9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mrpl50Q8VDT9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mrpl50Q8VDT9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mrpl50Q8VDT9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mrpl50Q8VDT9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mrpl50Q8VDT9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mrpl50Q8VDT9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mrpl50Q8VDT9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Mrpl50Q8VDT9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mrpl50Q8VDT9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mrpl50Q8VDT9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mrpl50Q8VDT9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mrpl50Q8VDT9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Mrpl50Q8VDT9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms