Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC6

Ccm2l, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2lQ8VCC6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccm2lQ8VCC6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccm2lQ8VCC6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccm2lQ8VCC6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccm2lQ8VCC6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccm2lQ8VCC6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccm2lQ8VCC6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccm2lQ8VCC6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccm2lQ8VCC6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccm2lQ8VCC6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccm2lQ8VCC6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccm2lQ8VCC6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccm2lQ8VCC6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccm2lQ8VCC6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccm2lQ8VCC6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccm2lQ8VCC6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccm2lQ8VCC6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccm2lQ8VCC6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccm2lQ8VCC6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccm2lQ8VCC6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccm2lQ8VCC6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccm2lQ8VCC6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccm2lQ8VCC6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccm2lQ8VCC6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccm2lQ8VCC6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccm2lQ8VCC6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccm2lQ8VCC6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccm2lQ8VCC6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccm2lQ8VCC6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccm2lQ8VCC6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccm2lQ8VCC6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccm2lQ8VCC6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccm2lQ8VCC6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccm2lQ8VCC6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccm2lQ8VCC6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccm2lQ8VCC6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccm2lQ8VCC6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccm2lQ8VCC6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccm2lQ8VCC6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccm2lQ8VCC6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccm2lQ8VCC6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccm2lQ8VCC6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccm2lQ8VCC6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccm2lQ8VCC6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccm2lQ8VCC6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccm2lQ8VCC6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccm2lQ8VCC6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccm2lQ8VCC6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccm2lQ8VCC6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccm2lQ8VCC6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccm2lQ8VCC6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccm2lQ8VCC6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccm2lQ8VCC6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccm2lQ8VCC6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccm2lQ8VCC6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccm2lQ8VCC6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccm2lQ8VCC6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccm2lQ8VCC6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccm2lQ8VCC6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccm2lQ8VCC6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccm2lQ8VCC6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccm2lQ8VCC6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccm2lQ8VCC6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccm2lQ8VCC6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccm2lQ8VCC6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccm2lQ8VCC6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccm2lQ8VCC6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccm2lQ8VCC6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccm2lQ8VCC6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccm2lQ8VCC6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccm2lQ8VCC6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccm2lQ8VCC6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccm2lQ8VCC6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccm2lQ8VCC6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccm2lQ8VCC6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccm2lQ8VCC6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccm2lQ8VCC6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccm2lQ8VCC6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccm2lQ8VCC6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccm2lQ8VCC6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccm2lQ8VCC6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccm2lQ8VCC6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccm2lQ8VCC6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccm2lQ8VCC6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccm2lQ8VCC6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccm2lQ8VCC6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccm2lQ8VCC6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccm2lQ8VCC6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccm2lQ8VCC6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccm2lQ8VCC6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccm2lQ8VCC6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccm2lQ8VCC6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccm2lQ8VCC6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccm2lQ8VCC6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccm2lQ8VCC6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccm2lQ8VCC6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccm2lQ8VCC6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccm2lQ8VCC6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccm2lQ8VCC6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccm2lQ8VCC6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms