Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3R8

Gabarapl1, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabarapl1Q8R3R8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gabarapl1Q8R3R8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gabarapl1Q8R3R8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gabarapl1Q8R3R8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gabarapl1Q8R3R8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gabarapl1Q8R3R8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gabarapl1Q8R3R8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gabarapl1Q8R3R8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gabarapl1Q8R3R8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gabarapl1Q8R3R8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gabarapl1Q8R3R8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gabarapl1Q8R3R8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gabarapl1Q8R3R8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gabarapl1Q8R3R8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gabarapl1Q8R3R8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gabarapl1Q8R3R8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabarapl1Q8R3R8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabarapl1Q8R3R8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabarapl1Q8R3R8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabarapl1Q8R3R8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gabarapl1Q8R3R8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gabarapl1Q8R3R8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gabarapl1Q8R3R8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabarapl1Q8R3R8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabarapl1Q8R3R8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabarapl1Q8R3R8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabarapl1Q8R3R8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabarapl1Q8R3R8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabarapl1Q8R3R8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabarapl1Q8R3R8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabarapl1Q8R3R8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabarapl1Q8R3R8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gabarapl1Q8R3R8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gabarapl1Q8R3R8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gabarapl1Q8R3R8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gabarapl1Q8R3R8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gabarapl1Q8R3R8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gabarapl1Q8R3R8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabarapl1Q8R3R8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabarapl1Q8R3R8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabarapl1Q8R3R8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabarapl1Q8R3R8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabarapl1Q8R3R8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabarapl1Q8R3R8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gabarapl1Q8R3R8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabarapl1Q8R3R8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabarapl1Q8R3R8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabarapl1Q8R3R8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabarapl1Q8R3R8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabarapl1Q8R3R8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabarapl1Q8R3R8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabarapl1Q8R3R8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabarapl1Q8R3R8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabarapl1Q8R3R8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabarapl1Q8R3R8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabarapl1Q8R3R8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabarapl1Q8R3R8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabarapl1Q8R3R8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabarapl1Q8R3R8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabarapl1Q8R3R8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gabarapl1Q8R3R8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabarapl1Q8R3R8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabarapl1Q8R3R8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabarapl1Q8R3R8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabarapl1Q8R3R8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabarapl1Q8R3R8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabarapl1Q8R3R8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabarapl1Q8R3R8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabarapl1Q8R3R8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gabarapl1Q8R3R8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabarapl1Q8R3R8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabarapl1Q8R3R8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabarapl1Q8R3R8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabarapl1Q8R3R8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabarapl1Q8R3R8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabarapl1Q8R3R8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabarapl1Q8R3R8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabarapl1Q8R3R8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabarapl1Q8R3R8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabarapl1Q8R3R8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabarapl1Q8R3R8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabarapl1Q8R3R8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabarapl1Q8R3R8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabarapl1Q8R3R8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabarapl1Q8R3R8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabarapl1Q8R3R8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabarapl1Q8R3R8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabarapl1Q8R3R8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabarapl1Q8R3R8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabarapl1Q8R3R8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabarapl1Q8R3R8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabarapl1Q8R3R8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabarapl1Q8R3R8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabarapl1Q8R3R8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabarapl1Q8R3R8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabarapl1Q8R3R8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabarapl1Q8R3R8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gabarapl1Q8R3R8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gabarapl1Q8R3R8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabarapl1Q8R3R8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms