Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C0

Mcmbp, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
McmbpQ8R3C0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
McmbpQ8R3C0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
McmbpQ8R3C0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
McmbpQ8R3C0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
McmbpQ8R3C0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
McmbpQ8R3C0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
McmbpQ8R3C0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
McmbpQ8R3C0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
McmbpQ8R3C0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
McmbpQ8R3C0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
McmbpQ8R3C0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
McmbpQ8R3C0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
McmbpQ8R3C0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
McmbpQ8R3C0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
McmbpQ8R3C0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
McmbpQ8R3C0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
McmbpQ8R3C0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
McmbpQ8R3C0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
McmbpQ8R3C0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
McmbpQ8R3C0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
McmbpQ8R3C0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
McmbpQ8R3C0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
McmbpQ8R3C0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
McmbpQ8R3C0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
McmbpQ8R3C0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
McmbpQ8R3C0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
McmbpQ8R3C0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
McmbpQ8R3C0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
McmbpQ8R3C0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
McmbpQ8R3C0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
McmbpQ8R3C0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
McmbpQ8R3C0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
McmbpQ8R3C0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
McmbpQ8R3C0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
McmbpQ8R3C0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
McmbpQ8R3C0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
McmbpQ8R3C0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
McmbpQ8R3C0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
McmbpQ8R3C0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
McmbpQ8R3C0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
McmbpQ8R3C0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
McmbpQ8R3C0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
McmbpQ8R3C0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
McmbpQ8R3C0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
McmbpQ8R3C0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
McmbpQ8R3C0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
McmbpQ8R3C0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
McmbpQ8R3C0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
McmbpQ8R3C0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
McmbpQ8R3C0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
McmbpQ8R3C0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
McmbpQ8R3C0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
McmbpQ8R3C0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
McmbpQ8R3C0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
McmbpQ8R3C0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
McmbpQ8R3C0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
McmbpQ8R3C0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
McmbpQ8R3C0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
McmbpQ8R3C0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
McmbpQ8R3C0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
McmbpQ8R3C0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
McmbpQ8R3C0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
McmbpQ8R3C0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
McmbpQ8R3C0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
McmbpQ8R3C0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
McmbpQ8R3C0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
McmbpQ8R3C0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
McmbpQ8R3C0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
McmbpQ8R3C0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
McmbpQ8R3C0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
McmbpQ8R3C0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
McmbpQ8R3C0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
McmbpQ8R3C0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
McmbpQ8R3C0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
McmbpQ8R3C0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
McmbpQ8R3C0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
McmbpQ8R3C0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
McmbpQ8R3C0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
McmbpQ8R3C0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
McmbpQ8R3C0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
McmbpQ8R3C0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
McmbpQ8R3C0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
McmbpQ8R3C0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
McmbpQ8R3C0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
McmbpQ8R3C0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
McmbpQ8R3C0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
McmbpQ8R3C0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
McmbpQ8R3C0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
McmbpQ8R3C0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
McmbpQ8R3C0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
McmbpQ8R3C0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
McmbpQ8R3C0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
McmbpQ8R3C0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
McmbpQ8R3C0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
McmbpQ8R3C0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
McmbpQ8R3C0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
McmbpQ8R3C0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
McmbpQ8R3C0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
McmbpQ8R3C0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
McmbpQ8R3C0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms