Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1H0

Hopx, Homeodomain-only protein, mousemouse

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HopxQ8R1H0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HopxQ8R1H0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HopxQ8R1H0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HopxQ8R1H0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HopxQ8R1H0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HopxQ8R1H0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HopxQ8R1H0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HopxQ8R1H0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HopxQ8R1H0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HopxQ8R1H0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HopxQ8R1H0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HopxQ8R1H0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HopxQ8R1H0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HopxQ8R1H0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HopxQ8R1H0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HopxQ8R1H0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HopxQ8R1H0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HopxQ8R1H0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HopxQ8R1H0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HopxQ8R1H0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HopxQ8R1H0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HopxQ8R1H0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HopxQ8R1H0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HopxQ8R1H0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HopxQ8R1H0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HopxQ8R1H0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HopxQ8R1H0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HopxQ8R1H0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HopxQ8R1H0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HopxQ8R1H0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HopxQ8R1H0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HopxQ8R1H0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HopxQ8R1H0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HopxQ8R1H0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HopxQ8R1H0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HopxQ8R1H0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HopxQ8R1H0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HopxQ8R1H0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HopxQ8R1H0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HopxQ8R1H0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HopxQ8R1H0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HopxQ8R1H0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HopxQ8R1H0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HopxQ8R1H0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HopxQ8R1H0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HopxQ8R1H0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HopxQ8R1H0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HopxQ8R1H0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HopxQ8R1H0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HopxQ8R1H0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HopxQ8R1H0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HopxQ8R1H0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HopxQ8R1H0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HopxQ8R1H0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HopxQ8R1H0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HopxQ8R1H0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HopxQ8R1H0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HopxQ8R1H0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HopxQ8R1H0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HopxQ8R1H0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HopxQ8R1H0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HopxQ8R1H0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HopxQ8R1H0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HopxQ8R1H0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HopxQ8R1H0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HopxQ8R1H0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HopxQ8R1H0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HopxQ8R1H0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HopxQ8R1H0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HopxQ8R1H0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HopxQ8R1H0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HopxQ8R1H0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HopxQ8R1H0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HopxQ8R1H0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HopxQ8R1H0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HopxQ8R1H0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HopxQ8R1H0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HopxQ8R1H0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HopxQ8R1H0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HopxQ8R1H0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HopxQ8R1H0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HopxQ8R1H0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HopxQ8R1H0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HopxQ8R1H0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HopxQ8R1H0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HopxQ8R1H0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HopxQ8R1H0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HopxQ8R1H0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HopxQ8R1H0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HopxQ8R1H0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HopxQ8R1H0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HopxQ8R1H0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HopxQ8R1H0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HopxQ8R1H0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HopxQ8R1H0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HopxQ8R1H0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HopxQ8R1H0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HopxQ8R1H0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HopxQ8R1H0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HopxQ8R1H0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms