Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pacs1Q8K212 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pacs1Q8K212 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pacs1Q8K212 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pacs1Q8K212 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pacs1Q8K212 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pacs1Q8K212 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pacs1Q8K212 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pacs1Q8K212 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pacs1Q8K212 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pacs1Q8K212 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pacs1Q8K212 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pacs1Q8K212 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pacs1Q8K212 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pacs1Q8K212 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pacs1Q8K212 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pacs1Q8K212 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pacs1Q8K212 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pacs1Q8K212 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pacs1Q8K212 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pacs1Q8K212 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pacs1Q8K212 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pacs1Q8K212 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pacs1Q8K212 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pacs1Q8K212 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pacs1Q8K212 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pacs1Q8K212 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pacs1Q8K212 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pacs1Q8K212 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pacs1Q8K212 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pacs1Q8K212 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pacs1Q8K212 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pacs1Q8K212 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pacs1Q8K212 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pacs1Q8K212 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pacs1Q8K212 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pacs1Q8K212 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pacs1Q8K212 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pacs1Q8K212 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pacs1Q8K212 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pacs1Q8K212 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pacs1Q8K212 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pacs1Q8K212 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pacs1Q8K212 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pacs1Q8K212 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pacs1Q8K212 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pacs1Q8K212 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pacs1Q8K212 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Pacs1Q8K212 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pacs1Q8K212 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pacs1Q8K212 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pacs1Q8K212 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pacs1Q8K212 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pacs1Q8K212 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pacs1Q8K212 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pacs1Q8K212 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pacs1Q8K212 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pacs1Q8K212 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pacs1Q8K212 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pacs1Q8K212 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pacs1Q8K212 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pacs1Q8K212 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pacs1Q8K212 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pacs1Q8K212 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pacs1Q8K212 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pacs1Q8K212 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pacs1Q8K212 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pacs1Q8K212 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pacs1Q8K212 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pacs1Q8K212 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pacs1Q8K212 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pacs1Q8K212 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pacs1Q8K212 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pacs1Q8K212 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pacs1Q8K212 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pacs1Q8K212 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pacs1Q8K212 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pacs1Q8K212 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pacs1Q8K212 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pacs1Q8K212 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pacs1Q8K212 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pacs1Q8K212 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pacs1Q8K212 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pacs1Q8K212 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pacs1Q8K212 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pacs1Q8K212 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pacs1Q8K212 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pacs1Q8K212 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pacs1Q8K212 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pacs1Q8K212 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pacs1Q8K212 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pacs1Q8K212 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pacs1Q8K212 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pacs1Q8K212 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pacs1Q8K212 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pacs1Q8K212 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pacs1Q8K212 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pacs1Q8K212 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pacs1Q8K212 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pacs1Q8K212 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms