Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE0

Serpina11, Serpin A11, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina11Q8CIE0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Serpina11Q8CIE0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Serpina11Q8CIE0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Serpina11Q8CIE0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Serpina11Q8CIE0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Serpina11Q8CIE0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Serpina11Q8CIE0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Serpina11Q8CIE0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Serpina11Q8CIE0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Serpina11Q8CIE0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Serpina11Q8CIE0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Serpina11Q8CIE0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Serpina11Q8CIE0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Serpina11Q8CIE0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Serpina11Q8CIE0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Serpina11Q8CIE0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Serpina11Q8CIE0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Serpina11Q8CIE0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Serpina11Q8CIE0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Serpina11Q8CIE0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Serpina11Q8CIE0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Serpina11Q8CIE0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Serpina11Q8CIE0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Serpina11Q8CIE0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Serpina11Q8CIE0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Serpina11Q8CIE0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Serpina11Q8CIE0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Serpina11Q8CIE0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Serpina11Q8CIE0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Serpina11Q8CIE0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Serpina11Q8CIE0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Serpina11Q8CIE0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Serpina11Q8CIE0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Serpina11Q8CIE0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Serpina11Q8CIE0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Serpina11Q8CIE0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Serpina11Q8CIE0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Serpina11Q8CIE0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Serpina11Q8CIE0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Serpina11Q8CIE0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Serpina11Q8CIE0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Serpina11Q8CIE0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Serpina11Q8CIE0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Serpina11Q8CIE0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Serpina11Q8CIE0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Serpina11Q8CIE0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Serpina11Q8CIE0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Serpina11Q8CIE0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Serpina11Q8CIE0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Serpina11Q8CIE0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Serpina11Q8CIE0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Serpina11Q8CIE0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Serpina11Q8CIE0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Serpina11Q8CIE0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Serpina11Q8CIE0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Serpina11Q8CIE0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Serpina11Q8CIE0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Serpina11Q8CIE0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Serpina11Q8CIE0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Serpina11Q8CIE0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Serpina11Q8CIE0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Serpina11Q8CIE0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Serpina11Q8CIE0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Serpina11Q8CIE0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Serpina11Q8CIE0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Serpina11Q8CIE0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Serpina11Q8CIE0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Serpina11Q8CIE0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Serpina11Q8CIE0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Serpina11Q8CIE0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Serpina11Q8CIE0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Serpina11Q8CIE0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Serpina11Q8CIE0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Serpina11Q8CIE0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Serpina11Q8CIE0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Serpina11Q8CIE0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Serpina11Q8CIE0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Serpina11Q8CIE0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Serpina11Q8CIE0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Serpina11Q8CIE0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Serpina11Q8CIE0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Serpina11Q8CIE0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Serpina11Q8CIE0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Serpina11Q8CIE0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Serpina11Q8CIE0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Serpina11Q8CIE0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Serpina11Q8CIE0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Serpina11Q8CIE0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Serpina11Q8CIE0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Serpina11Q8CIE0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Serpina11Q8CIE0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Serpina11Q8CIE0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Serpina11Q8CIE0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Serpina11Q8CIE0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Serpina11Q8CIE0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Serpina11Q8CIE0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Serpina11Q8CIE0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Serpina11Q8CIE0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Serpina11Q8CIE0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Serpina11Q8CIE0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms