Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc43a2Q8CGA3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc43a2Q8CGA3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc43a2Q8CGA3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc43a2Q8CGA3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc43a2Q8CGA3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc43a2Q8CGA3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc43a2Q8CGA3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc43a2Q8CGA3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc43a2Q8CGA3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc43a2Q8CGA3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc43a2Q8CGA3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc43a2Q8CGA3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc43a2Q8CGA3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc43a2Q8CGA3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc43a2Q8CGA3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc43a2Q8CGA3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc43a2Q8CGA3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc43a2Q8CGA3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc43a2Q8CGA3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc43a2Q8CGA3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc43a2Q8CGA3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc43a2Q8CGA3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc43a2Q8CGA3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc43a2Q8CGA3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc43a2Q8CGA3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc43a2Q8CGA3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc43a2Q8CGA3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc43a2Q8CGA3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc43a2Q8CGA3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc43a2Q8CGA3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc43a2Q8CGA3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc43a2Q8CGA3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc43a2Q8CGA3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc43a2Q8CGA3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc43a2Q8CGA3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc43a2Q8CGA3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc43a2Q8CGA3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc43a2Q8CGA3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc43a2Q8CGA3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc43a2Q8CGA3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc43a2Q8CGA3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc43a2Q8CGA3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc43a2Q8CGA3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc43a2Q8CGA3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc43a2Q8CGA3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc43a2Q8CGA3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc43a2Q8CGA3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc43a2Q8CGA3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc43a2Q8CGA3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc43a2Q8CGA3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc43a2Q8CGA3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc43a2Q8CGA3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc43a2Q8CGA3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc43a2Q8CGA3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc43a2Q8CGA3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc43a2Q8CGA3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc43a2Q8CGA3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc43a2Q8CGA3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc43a2Q8CGA3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc43a2Q8CGA3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc43a2Q8CGA3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc43a2Q8CGA3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc43a2Q8CGA3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc43a2Q8CGA3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc43a2Q8CGA3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc43a2Q8CGA3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc43a2Q8CGA3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc43a2Q8CGA3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc43a2Q8CGA3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc43a2Q8CGA3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc43a2Q8CGA3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc43a2Q8CGA3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc43a2Q8CGA3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc43a2Q8CGA3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc43a2Q8CGA3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc43a2Q8CGA3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc43a2Q8CGA3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc43a2Q8CGA3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc43a2Q8CGA3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc43a2Q8CGA3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc43a2Q8CGA3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc43a2Q8CGA3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc43a2Q8CGA3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc43a2Q8CGA3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc43a2Q8CGA3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc43a2Q8CGA3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc43a2Q8CGA3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc43a2Q8CGA3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc43a2Q8CGA3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc43a2Q8CGA3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc43a2Q8CGA3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc43a2Q8CGA3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc43a2Q8CGA3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc43a2Q8CGA3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc43a2Q8CGA3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc43a2Q8CGA3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc43a2Q8CGA3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc43a2Q8CGA3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc43a2Q8CGA3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms