Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nup88Q8CEC0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nup88Q8CEC0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nup88Q8CEC0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nup88Q8CEC0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nup88Q8CEC0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nup88Q8CEC0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nup88Q8CEC0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nup88Q8CEC0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nup88Q8CEC0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nup88Q8CEC0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Nup88Q8CEC0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nup88Q8CEC0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nup88Q8CEC0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nup88Q8CEC0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nup88Q8CEC0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nup88Q8CEC0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nup88Q8CEC0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nup88Q8CEC0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nup88Q8CEC0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nup88Q8CEC0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nup88Q8CEC0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nup88Q8CEC0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nup88Q8CEC0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nup88Q8CEC0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nup88Q8CEC0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nup88Q8CEC0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nup88Q8CEC0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Nup88Q8CEC0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nup88Q8CEC0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nup88Q8CEC0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nup88Q8CEC0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nup88Q8CEC0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nup88Q8CEC0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nup88Q8CEC0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nup88Q8CEC0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nup88Q8CEC0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nup88Q8CEC0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nup88Q8CEC0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nup88Q8CEC0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nup88Q8CEC0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nup88Q8CEC0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nup88Q8CEC0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nup88Q8CEC0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nup88Q8CEC0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nup88Q8CEC0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nup88Q8CEC0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nup88Q8CEC0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nup88Q8CEC0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nup88Q8CEC0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nup88Q8CEC0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nup88Q8CEC0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nup88Q8CEC0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nup88Q8CEC0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nup88Q8CEC0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nup88Q8CEC0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nup88Q8CEC0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nup88Q8CEC0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nup88Q8CEC0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nup88Q8CEC0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nup88Q8CEC0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Nup88Q8CEC0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nup88Q8CEC0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nup88Q8CEC0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Nup88Q8CEC0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nup88Q8CEC0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nup88Q8CEC0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nup88Q8CEC0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nup88Q8CEC0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nup88Q8CEC0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nup88Q8CEC0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nup88Q8CEC0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Nup88Q8CEC0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nup88Q8CEC0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Nup88Q8CEC0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nup88Q8CEC0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nup88Q8CEC0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nup88Q8CEC0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nup88Q8CEC0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nup88Q8CEC0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nup88Q8CEC0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nup88Q8CEC0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nup88Q8CEC0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nup88Q8CEC0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nup88Q8CEC0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nup88Q8CEC0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nup88Q8CEC0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nup88Q8CEC0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nup88Q8CEC0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nup88Q8CEC0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nup88Q8CEC0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nup88Q8CEC0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nup88Q8CEC0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nup88Q8CEC0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nup88Q8CEC0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nup88Q8CEC0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nup88Q8CEC0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nup88Q8CEC0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nup88Q8CEC0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nup88Q8CEC0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms