Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCX5

Krt222, Keratin-like protein KRT222, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt222Q8CCX5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt222Q8CCX5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt222Q8CCX5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt222Q8CCX5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt222Q8CCX5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt222Q8CCX5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt222Q8CCX5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt222Q8CCX5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt222Q8CCX5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt222Q8CCX5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt222Q8CCX5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt222Q8CCX5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt222Q8CCX5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Krt222Q8CCX5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt222Q8CCX5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt222Q8CCX5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt222Q8CCX5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt222Q8CCX5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt222Q8CCX5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt222Q8CCX5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt222Q8CCX5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt222Q8CCX5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt222Q8CCX5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt222Q8CCX5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt222Q8CCX5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt222Q8CCX5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt222Q8CCX5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt222Q8CCX5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt222Q8CCX5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt222Q8CCX5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Krt222Q8CCX5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt222Q8CCX5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt222Q8CCX5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt222Q8CCX5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt222Q8CCX5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt222Q8CCX5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt222Q8CCX5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt222Q8CCX5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt222Q8CCX5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt222Q8CCX5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt222Q8CCX5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt222Q8CCX5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt222Q8CCX5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt222Q8CCX5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt222Q8CCX5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt222Q8CCX5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt222Q8CCX5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt222Q8CCX5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt222Q8CCX5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt222Q8CCX5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt222Q8CCX5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt222Q8CCX5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt222Q8CCX5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt222Q8CCX5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt222Q8CCX5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt222Q8CCX5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt222Q8CCX5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt222Q8CCX5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt222Q8CCX5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt222Q8CCX5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt222Q8CCX5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt222Q8CCX5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt222Q8CCX5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt222Q8CCX5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt222Q8CCX5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt222Q8CCX5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt222Q8CCX5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt222Q8CCX5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt222Q8CCX5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt222Q8CCX5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt222Q8CCX5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt222Q8CCX5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt222Q8CCX5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt222Q8CCX5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt222Q8CCX5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt222Q8CCX5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt222Q8CCX5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt222Q8CCX5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt222Q8CCX5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt222Q8CCX5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt222Q8CCX5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt222Q8CCX5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt222Q8CCX5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt222Q8CCX5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt222Q8CCX5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt222Q8CCX5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt222Q8CCX5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt222Q8CCX5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt222Q8CCX5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt222Q8CCX5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt222Q8CCX5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt222Q8CCX5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt222Q8CCX5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Krt222Q8CCX5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt222Q8CCX5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt222Q8CCX5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt222Q8CCX5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt222Q8CCX5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt222Q8CCX5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt222Q8CCX5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms