Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCK0

H2afy2, Core histone macro-H2A.2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afy2Q8CCK0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2afy2Q8CCK0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2afy2Q8CCK0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2afy2Q8CCK0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2afy2Q8CCK0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2afy2Q8CCK0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2afy2Q8CCK0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
H2afy2Q8CCK0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
H2afy2Q8CCK0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
H2afy2Q8CCK0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2afy2Q8CCK0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2afy2Q8CCK0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2afy2Q8CCK0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2afy2Q8CCK0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2afy2Q8CCK0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2afy2Q8CCK0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
H2afy2Q8CCK0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2afy2Q8CCK0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2afy2Q8CCK0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
H2afy2Q8CCK0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2afy2Q8CCK0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2afy2Q8CCK0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2afy2Q8CCK0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2afy2Q8CCK0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2afy2Q8CCK0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2afy2Q8CCK0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afy2Q8CCK0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afy2Q8CCK0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms