Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6U2

Pqlc3, PQ-loop repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pqlc3Q8C6U2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pqlc3Q8C6U2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pqlc3Q8C6U2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pqlc3Q8C6U2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pqlc3Q8C6U2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pqlc3Q8C6U2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pqlc3Q8C6U2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pqlc3Q8C6U2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pqlc3Q8C6U2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pqlc3Q8C6U2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pqlc3Q8C6U2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pqlc3Q8C6U2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pqlc3Q8C6U2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Pqlc3Q8C6U2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pqlc3Q8C6U2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pqlc3Q8C6U2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pqlc3Q8C6U2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pqlc3Q8C6U2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pqlc3Q8C6U2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pqlc3Q8C6U2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pqlc3Q8C6U2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pqlc3Q8C6U2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pqlc3Q8C6U2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pqlc3Q8C6U2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pqlc3Q8C6U2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pqlc3Q8C6U2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pqlc3Q8C6U2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pqlc3Q8C6U2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pqlc3Q8C6U2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pqlc3Q8C6U2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pqlc3Q8C6U2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pqlc3Q8C6U2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pqlc3Q8C6U2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pqlc3Q8C6U2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pqlc3Q8C6U2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pqlc3Q8C6U2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pqlc3Q8C6U2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pqlc3Q8C6U2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pqlc3Q8C6U2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pqlc3Q8C6U2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pqlc3Q8C6U2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pqlc3Q8C6U2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pqlc3Q8C6U2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pqlc3Q8C6U2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pqlc3Q8C6U2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pqlc3Q8C6U2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pqlc3Q8C6U2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pqlc3Q8C6U2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pqlc3Q8C6U2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pqlc3Q8C6U2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pqlc3Q8C6U2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pqlc3Q8C6U2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pqlc3Q8C6U2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pqlc3Q8C6U2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pqlc3Q8C6U2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pqlc3Q8C6U2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pqlc3Q8C6U2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pqlc3Q8C6U2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pqlc3Q8C6U2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pqlc3Q8C6U2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pqlc3Q8C6U2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pqlc3Q8C6U2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pqlc3Q8C6U2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pqlc3Q8C6U2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pqlc3Q8C6U2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pqlc3Q8C6U2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pqlc3Q8C6U2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pqlc3Q8C6U2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pqlc3Q8C6U2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pqlc3Q8C6U2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pqlc3Q8C6U2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pqlc3Q8C6U2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pqlc3Q8C6U2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pqlc3Q8C6U2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pqlc3Q8C6U2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pqlc3Q8C6U2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pqlc3Q8C6U2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pqlc3Q8C6U2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pqlc3Q8C6U2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pqlc3Q8C6U2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pqlc3Q8C6U2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pqlc3Q8C6U2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pqlc3Q8C6U2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pqlc3Q8C6U2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pqlc3Q8C6U2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pqlc3Q8C6U2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pqlc3Q8C6U2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pqlc3Q8C6U2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pqlc3Q8C6U2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pqlc3Q8C6U2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pqlc3Q8C6U2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pqlc3Q8C6U2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pqlc3Q8C6U2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pqlc3Q8C6U2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pqlc3Q8C6U2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pqlc3Q8C6U2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pqlc3Q8C6U2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pqlc3Q8C6U2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pqlc3Q8C6U2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pqlc3Q8C6U2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms