Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg16l1Q8C0J2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg16l1Q8C0J2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg16l1Q8C0J2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg16l1Q8C0J2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg16l1Q8C0J2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg16l1Q8C0J2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg16l1Q8C0J2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg16l1Q8C0J2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg16l1Q8C0J2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg16l1Q8C0J2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg16l1Q8C0J2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg16l1Q8C0J2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg16l1Q8C0J2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg16l1Q8C0J2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg16l1Q8C0J2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg16l1Q8C0J2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg16l1Q8C0J2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg16l1Q8C0J2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg16l1Q8C0J2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg16l1Q8C0J2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg16l1Q8C0J2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg16l1Q8C0J2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atg16l1Q8C0J2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg16l1Q8C0J2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg16l1Q8C0J2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg16l1Q8C0J2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg16l1Q8C0J2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg16l1Q8C0J2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg16l1Q8C0J2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg16l1Q8C0J2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg16l1Q8C0J2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg16l1Q8C0J2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg16l1Q8C0J2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg16l1Q8C0J2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg16l1Q8C0J2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg16l1Q8C0J2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg16l1Q8C0J2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg16l1Q8C0J2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg16l1Q8C0J2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atg16l1Q8C0J2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg16l1Q8C0J2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg16l1Q8C0J2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg16l1Q8C0J2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg16l1Q8C0J2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg16l1Q8C0J2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg16l1Q8C0J2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg16l1Q8C0J2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg16l1Q8C0J2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg16l1Q8C0J2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg16l1Q8C0J2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg16l1Q8C0J2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg16l1Q8C0J2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg16l1Q8C0J2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg16l1Q8C0J2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg16l1Q8C0J2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg16l1Q8C0J2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg16l1Q8C0J2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg16l1Q8C0J2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg16l1Q8C0J2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg16l1Q8C0J2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg16l1Q8C0J2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg16l1Q8C0J2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg16l1Q8C0J2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg16l1Q8C0J2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg16l1Q8C0J2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg16l1Q8C0J2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg16l1Q8C0J2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg16l1Q8C0J2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg16l1Q8C0J2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg16l1Q8C0J2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg16l1Q8C0J2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg16l1Q8C0J2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg16l1Q8C0J2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg16l1Q8C0J2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg16l1Q8C0J2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg16l1Q8C0J2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg16l1Q8C0J2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg16l1Q8C0J2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg16l1Q8C0J2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg16l1Q8C0J2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg16l1Q8C0J2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg16l1Q8C0J2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg16l1Q8C0J2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg16l1Q8C0J2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg16l1Q8C0J2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg16l1Q8C0J2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg16l1Q8C0J2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg16l1Q8C0J2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg16l1Q8C0J2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg16l1Q8C0J2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg16l1Q8C0J2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg16l1Q8C0J2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg16l1Q8C0J2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg16l1Q8C0J2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg16l1Q8C0J2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg16l1Q8C0J2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms