Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rccd1Q8BTU7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rccd1Q8BTU7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rccd1Q8BTU7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rccd1Q8BTU7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rccd1Q8BTU7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rccd1Q8BTU7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rccd1Q8BTU7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rccd1Q8BTU7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rccd1Q8BTU7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rccd1Q8BTU7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rccd1Q8BTU7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rccd1Q8BTU7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rccd1Q8BTU7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rccd1Q8BTU7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rccd1Q8BTU7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rccd1Q8BTU7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rccd1Q8BTU7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rccd1Q8BTU7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rccd1Q8BTU7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rccd1Q8BTU7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rccd1Q8BTU7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rccd1Q8BTU7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rccd1Q8BTU7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rccd1Q8BTU7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rccd1Q8BTU7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rccd1Q8BTU7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rccd1Q8BTU7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rccd1Q8BTU7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rccd1Q8BTU7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rccd1Q8BTU7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rccd1Q8BTU7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rccd1Q8BTU7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rccd1Q8BTU7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rccd1Q8BTU7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rccd1Q8BTU7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rccd1Q8BTU7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rccd1Q8BTU7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rccd1Q8BTU7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rccd1Q8BTU7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rccd1Q8BTU7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rccd1Q8BTU7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rccd1Q8BTU7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rccd1Q8BTU7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rccd1Q8BTU7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rccd1Q8BTU7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rccd1Q8BTU7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rccd1Q8BTU7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rccd1Q8BTU7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rccd1Q8BTU7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rccd1Q8BTU7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rccd1Q8BTU7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rccd1Q8BTU7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rccd1Q8BTU7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rccd1Q8BTU7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rccd1Q8BTU7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rccd1Q8BTU7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rccd1Q8BTU7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rccd1Q8BTU7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rccd1Q8BTU7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rccd1Q8BTU7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rccd1Q8BTU7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rccd1Q8BTU7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rccd1Q8BTU7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rccd1Q8BTU7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rccd1Q8BTU7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rccd1Q8BTU7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rccd1Q8BTU7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rccd1Q8BTU7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rccd1Q8BTU7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rccd1Q8BTU7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rccd1Q8BTU7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rccd1Q8BTU7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rccd1Q8BTU7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rccd1Q8BTU7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Rccd1Q8BTU7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rccd1Q8BTU7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rccd1Q8BTU7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rccd1Q8BTU7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rccd1Q8BTU7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rccd1Q8BTU7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rccd1Q8BTU7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rccd1Q8BTU7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rccd1Q8BTU7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rccd1Q8BTU7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rccd1Q8BTU7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rccd1Q8BTU7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rccd1Q8BTU7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rccd1Q8BTU7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rccd1Q8BTU7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rccd1Q8BTU7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rccd1Q8BTU7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rccd1Q8BTU7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rccd1Q8BTU7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rccd1Q8BTU7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rccd1Q8BTU7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rccd1Q8BTU7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rccd1Q8BTU7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rccd1Q8BTU7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rccd1Q8BTU7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms