Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHN9

Clba1, Uncharacterized protein CLBA1, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clba1Q8BHN9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clba1Q8BHN9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clba1Q8BHN9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clba1Q8BHN9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clba1Q8BHN9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clba1Q8BHN9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clba1Q8BHN9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clba1Q8BHN9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clba1Q8BHN9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clba1Q8BHN9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clba1Q8BHN9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clba1Q8BHN9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clba1Q8BHN9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clba1Q8BHN9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clba1Q8BHN9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clba1Q8BHN9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clba1Q8BHN9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clba1Q8BHN9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clba1Q8BHN9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clba1Q8BHN9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clba1Q8BHN9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clba1Q8BHN9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clba1Q8BHN9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clba1Q8BHN9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clba1Q8BHN9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clba1Q8BHN9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clba1Q8BHN9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clba1Q8BHN9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clba1Q8BHN9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clba1Q8BHN9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clba1Q8BHN9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clba1Q8BHN9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clba1Q8BHN9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clba1Q8BHN9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clba1Q8BHN9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clba1Q8BHN9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clba1Q8BHN9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clba1Q8BHN9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clba1Q8BHN9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clba1Q8BHN9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clba1Q8BHN9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clba1Q8BHN9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clba1Q8BHN9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clba1Q8BHN9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clba1Q8BHN9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clba1Q8BHN9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clba1Q8BHN9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clba1Q8BHN9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clba1Q8BHN9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Clba1Q8BHN9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clba1Q8BHN9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clba1Q8BHN9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clba1Q8BHN9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clba1Q8BHN9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clba1Q8BHN9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clba1Q8BHN9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clba1Q8BHN9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clba1Q8BHN9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clba1Q8BHN9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clba1Q8BHN9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clba1Q8BHN9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clba1Q8BHN9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clba1Q8BHN9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clba1Q8BHN9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clba1Q8BHN9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clba1Q8BHN9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clba1Q8BHN9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clba1Q8BHN9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clba1Q8BHN9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clba1Q8BHN9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clba1Q8BHN9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clba1Q8BHN9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clba1Q8BHN9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clba1Q8BHN9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clba1Q8BHN9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clba1Q8BHN9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clba1Q8BHN9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clba1Q8BHN9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clba1Q8BHN9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clba1Q8BHN9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clba1Q8BHN9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clba1Q8BHN9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clba1Q8BHN9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clba1Q8BHN9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clba1Q8BHN9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clba1Q8BHN9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clba1Q8BHN9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clba1Q8BHN9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clba1Q8BHN9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clba1Q8BHN9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Clba1Q8BHN9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clba1Q8BHN9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clba1Q8BHN9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clba1Q8BHN9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clba1Q8BHN9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clba1Q8BHN9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clba1Q8BHN9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Clba1Q8BHN9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clba1Q8BHN9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Clba1Q8BHN9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms