Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Frmd3Q8BHD4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Frmd3Q8BHD4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Frmd3Q8BHD4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Frmd3Q8BHD4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Frmd3Q8BHD4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Frmd3Q8BHD4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmd3Q8BHD4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmd3Q8BHD4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmd3Q8BHD4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmd3Q8BHD4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmd3Q8BHD4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmd3Q8BHD4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmd3Q8BHD4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmd3Q8BHD4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Frmd3Q8BHD4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Frmd3Q8BHD4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Frmd3Q8BHD4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Frmd3Q8BHD4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Frmd3Q8BHD4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Frmd3Q8BHD4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmd3Q8BHD4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Frmd3Q8BHD4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Frmd3Q8BHD4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Frmd3Q8BHD4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Frmd3Q8BHD4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmd3Q8BHD4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmd3Q8BHD4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Frmd3Q8BHD4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Frmd3Q8BHD4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Frmd3Q8BHD4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Frmd3Q8BHD4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Frmd3Q8BHD4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Frmd3Q8BHD4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Frmd3Q8BHD4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Frmd3Q8BHD4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Frmd3Q8BHD4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Frmd3Q8BHD4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Frmd3Q8BHD4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Frmd3Q8BHD4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Frmd3Q8BHD4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Frmd3Q8BHD4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Frmd3Q8BHD4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Frmd3Q8BHD4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Frmd3Q8BHD4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Frmd3Q8BHD4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Frmd3Q8BHD4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Frmd3Q8BHD4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Frmd3Q8BHD4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Frmd3Q8BHD4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Frmd3Q8BHD4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Frmd3Q8BHD4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Frmd3Q8BHD4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Frmd3Q8BHD4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Frmd3Q8BHD4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Frmd3Q8BHD4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Frmd3Q8BHD4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Frmd3Q8BHD4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Frmd3Q8BHD4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Frmd3Q8BHD4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Frmd3Q8BHD4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Frmd3Q8BHD4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Frmd3Q8BHD4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Frmd3Q8BHD4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Frmd3Q8BHD4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Frmd3Q8BHD4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Frmd3Q8BHD4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Frmd3Q8BHD4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Frmd3Q8BHD4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Frmd3Q8BHD4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Frmd3Q8BHD4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Frmd3Q8BHD4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Frmd3Q8BHD4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Frmd3Q8BHD4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Frmd3Q8BHD4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Frmd3Q8BHD4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Frmd3Q8BHD4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Frmd3Q8BHD4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Frmd3Q8BHD4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Frmd3Q8BHD4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Frmd3Q8BHD4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Frmd3Q8BHD4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Frmd3Q8BHD4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Frmd3Q8BHD4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Frmd3Q8BHD4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Frmd3Q8BHD4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Frmd3Q8BHD4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Frmd3Q8BHD4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Frmd3Q8BHD4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Frmd3Q8BHD4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Frmd3Q8BHD4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Frmd3Q8BHD4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Frmd3Q8BHD4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Frmd3Q8BHD4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Frmd3Q8BHD4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms