Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFQ9

Klhl42, Kelch-like protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl42Q8BFQ9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl42Q8BFQ9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl42Q8BFQ9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl42Q8BFQ9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl42Q8BFQ9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl42Q8BFQ9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl42Q8BFQ9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl42Q8BFQ9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Klhl42Q8BFQ9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl42Q8BFQ9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl42Q8BFQ9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl42Q8BFQ9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl42Q8BFQ9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl42Q8BFQ9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl42Q8BFQ9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl42Q8BFQ9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl42Q8BFQ9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl42Q8BFQ9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl42Q8BFQ9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl42Q8BFQ9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl42Q8BFQ9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl42Q8BFQ9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klhl42Q8BFQ9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl42Q8BFQ9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl42Q8BFQ9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl42Q8BFQ9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl42Q8BFQ9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl42Q8BFQ9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl42Q8BFQ9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl42Q8BFQ9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl42Q8BFQ9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl42Q8BFQ9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl42Q8BFQ9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl42Q8BFQ9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl42Q8BFQ9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl42Q8BFQ9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl42Q8BFQ9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl42Q8BFQ9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl42Q8BFQ9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl42Q8BFQ9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl42Q8BFQ9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl42Q8BFQ9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl42Q8BFQ9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl42Q8BFQ9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl42Q8BFQ9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl42Q8BFQ9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl42Q8BFQ9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl42Q8BFQ9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl42Q8BFQ9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl42Q8BFQ9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl42Q8BFQ9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl42Q8BFQ9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl42Q8BFQ9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl42Q8BFQ9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl42Q8BFQ9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl42Q8BFQ9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl42Q8BFQ9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl42Q8BFQ9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl42Q8BFQ9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl42Q8BFQ9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl42Q8BFQ9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl42Q8BFQ9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl42Q8BFQ9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl42Q8BFQ9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl42Q8BFQ9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl42Q8BFQ9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl42Q8BFQ9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl42Q8BFQ9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl42Q8BFQ9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl42Q8BFQ9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl42Q8BFQ9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl42Q8BFQ9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl42Q8BFQ9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl42Q8BFQ9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Klhl42Q8BFQ9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhl42Q8BFQ9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhl42Q8BFQ9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhl42Q8BFQ9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl42Q8BFQ9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl42Q8BFQ9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhl42Q8BFQ9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhl42Q8BFQ9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhl42Q8BFQ9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhl42Q8BFQ9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhl42Q8BFQ9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhl42Q8BFQ9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhl42Q8BFQ9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl42Q8BFQ9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klhl42Q8BFQ9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl42Q8BFQ9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl42Q8BFQ9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl42Q8BFQ9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl42Q8BFQ9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl42Q8BFQ9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl42Q8BFQ9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhl42Q8BFQ9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhl42Q8BFQ9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhl42Q8BFQ9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhl42Q8BFQ9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhl42Q8BFQ9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms