Protein–RNA interactions for Protein: Q80U58

Pum2, Pumilio homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum2Q80U58 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pum2Q80U58 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pum2Q80U58 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pum2Q80U58 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pum2Q80U58 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pum2Q80U58 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pum2Q80U58 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pum2Q80U58 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pum2Q80U58 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pum2Q80U58 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pum2Q80U58 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pum2Q80U58 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pum2Q80U58 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pum2Q80U58 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pum2Q80U58 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pum2Q80U58 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pum2Q80U58 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pum2Q80U58 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pum2Q80U58 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pum2Q80U58 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pum2Q80U58 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pum2Q80U58 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pum2Q80U58 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pum2Q80U58 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pum2Q80U58 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pum2Q80U58 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pum2Q80U58 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pum2Q80U58 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pum2Q80U58 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pum2Q80U58 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pum2Q80U58 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pum2Q80U58 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pum2Q80U58 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pum2Q80U58 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pum2Q80U58 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pum2Q80U58 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pum2Q80U58 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pum2Q80U58 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pum2Q80U58 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pum2Q80U58 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pum2Q80U58 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pum2Q80U58 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pum2Q80U58 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pum2Q80U58 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pum2Q80U58 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pum2Q80U58 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pum2Q80U58 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pum2Q80U58 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pum2Q80U58 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pum2Q80U58 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pum2Q80U58 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pum2Q80U58 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pum2Q80U58 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pum2Q80U58 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pum2Q80U58 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pum2Q80U58 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pum2Q80U58 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pum2Q80U58 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pum2Q80U58 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pum2Q80U58 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pum2Q80U58 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pum2Q80U58 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pum2Q80U58 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pum2Q80U58 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pum2Q80U58 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pum2Q80U58 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pum2Q80U58 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pum2Q80U58 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pum2Q80U58 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pum2Q80U58 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pum2Q80U58 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pum2Q80U58 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pum2Q80U58 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pum2Q80U58 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pum2Q80U58 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pum2Q80U58 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pum2Q80U58 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pum2Q80U58 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pum2Q80U58 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pum2Q80U58 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pum2Q80U58 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pum2Q80U58 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pum2Q80U58 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pum2Q80U58 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pum2Q80U58 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pum2Q80U58 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pum2Q80U58 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pum2Q80U58 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pum2Q80U58 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pum2Q80U58 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pum2Q80U58 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pum2Q80U58 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pum2Q80U58 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pum2Q80U58 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pum2Q80U58 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pum2Q80U58 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pum2Q80U58 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pum2Q80U58 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pum2Q80U58 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pum2Q80U58 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms