Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pja2Q80U04 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pja2Q80U04 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pja2Q80U04 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pja2Q80U04 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pja2Q80U04 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pja2Q80U04 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Pja2Q80U04 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pja2Q80U04 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pja2Q80U04 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pja2Q80U04 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pja2Q80U04 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pja2Q80U04 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pja2Q80U04 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pja2Q80U04 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pja2Q80U04 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Pja2Q80U04 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pja2Q80U04 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pja2Q80U04 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Pja2Q80U04 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pja2Q80U04 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pja2Q80U04 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pja2Q80U04 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pja2Q80U04 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pja2Q80U04 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pja2Q80U04 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pja2Q80U04 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pja2Q80U04 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pja2Q80U04 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pja2Q80U04 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pja2Q80U04 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pja2Q80U04 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pja2Q80U04 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Pja2Q80U04 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pja2Q80U04 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pja2Q80U04 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pja2Q80U04 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pja2Q80U04 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pja2Q80U04 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pja2Q80U04 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pja2Q80U04 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pja2Q80U04 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pja2Q80U04 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pja2Q80U04 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pja2Q80U04 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pja2Q80U04 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pja2Q80U04 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pja2Q80U04 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pja2Q80U04 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Pja2Q80U04 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pja2Q80U04 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pja2Q80U04 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pja2Q80U04 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pja2Q80U04 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pja2Q80U04 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pja2Q80U04 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pja2Q80U04 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pja2Q80U04 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pja2Q80U04 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pja2Q80U04 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pja2Q80U04 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pja2Q80U04 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pja2Q80U04 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pja2Q80U04 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pja2Q80U04 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pja2Q80U04 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pja2Q80U04 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Pja2Q80U04 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pja2Q80U04 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pja2Q80U04 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pja2Q80U04 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pja2Q80U04 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pja2Q80U04 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pja2Q80U04 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pja2Q80U04 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pja2Q80U04 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pja2Q80U04 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pja2Q80U04 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pja2Q80U04 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pja2Q80U04 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Pja2Q80U04 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pja2Q80U04 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pja2Q80U04 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pja2Q80U04 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pja2Q80U04 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pja2Q80U04 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pja2Q80U04 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pja2Q80U04 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pja2Q80U04 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pja2Q80U04 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pja2Q80U04 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pja2Q80U04 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pja2Q80U04 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pja2Q80U04 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pja2Q80U04 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pja2Q80U04 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pja2Q80U04 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pja2Q80U04 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pja2Q80U04 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pja2Q80U04 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms