Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPG0

1700010I14Rik, GI:13385330, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700010I14RikQ7TPG0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
1700010I14RikQ7TPG0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
1700010I14RikQ7TPG0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
1700010I14RikQ7TPG0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
1700010I14RikQ7TPG0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
1700010I14RikQ7TPG0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
1700010I14RikQ7TPG0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
1700010I14RikQ7TPG0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
1700010I14RikQ7TPG0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
1700010I14RikQ7TPG0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
1700010I14RikQ7TPG0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
1700010I14RikQ7TPG0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
1700010I14RikQ7TPG0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
1700010I14RikQ7TPG0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
1700010I14RikQ7TPG0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
1700010I14RikQ7TPG0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
1700010I14RikQ7TPG0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
1700010I14RikQ7TPG0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
1700010I14RikQ7TPG0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
1700010I14RikQ7TPG0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
1700010I14RikQ7TPG0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
1700010I14RikQ7TPG0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
1700010I14RikQ7TPG0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
1700010I14RikQ7TPG0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
1700010I14RikQ7TPG0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
1700010I14RikQ7TPG0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
1700010I14RikQ7TPG0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
1700010I14RikQ7TPG0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
1700010I14RikQ7TPG0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
1700010I14RikQ7TPG0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
1700010I14RikQ7TPG0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
1700010I14RikQ7TPG0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
1700010I14RikQ7TPG0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
1700010I14RikQ7TPG0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
1700010I14RikQ7TPG0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
1700010I14RikQ7TPG0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
1700010I14RikQ7TPG0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
1700010I14RikQ7TPG0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
1700010I14RikQ7TPG0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
1700010I14RikQ7TPG0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
1700010I14RikQ7TPG0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
1700010I14RikQ7TPG0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
1700010I14RikQ7TPG0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
1700010I14RikQ7TPG0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
1700010I14RikQ7TPG0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
1700010I14RikQ7TPG0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
1700010I14RikQ7TPG0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
1700010I14RikQ7TPG0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
1700010I14RikQ7TPG0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
1700010I14RikQ7TPG0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
1700010I14RikQ7TPG0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
1700010I14RikQ7TPG0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
1700010I14RikQ7TPG0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
1700010I14RikQ7TPG0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
1700010I14RikQ7TPG0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
1700010I14RikQ7TPG0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
1700010I14RikQ7TPG0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
1700010I14RikQ7TPG0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
1700010I14RikQ7TPG0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
1700010I14RikQ7TPG0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
1700010I14RikQ7TPG0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
1700010I14RikQ7TPG0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
1700010I14RikQ7TPG0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
1700010I14RikQ7TPG0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
1700010I14RikQ7TPG0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
1700010I14RikQ7TPG0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
1700010I14RikQ7TPG0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
1700010I14RikQ7TPG0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
1700010I14RikQ7TPG0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
1700010I14RikQ7TPG0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
1700010I14RikQ7TPG0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
1700010I14RikQ7TPG0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
1700010I14RikQ7TPG0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
1700010I14RikQ7TPG0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
1700010I14RikQ7TPG0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
1700010I14RikQ7TPG0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
1700010I14RikQ7TPG0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
1700010I14RikQ7TPG0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
1700010I14RikQ7TPG0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
1700010I14RikQ7TPG0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
1700010I14RikQ7TPG0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
1700010I14RikQ7TPG0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
1700010I14RikQ7TPG0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
1700010I14RikQ7TPG0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
1700010I14RikQ7TPG0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
1700010I14RikQ7TPG0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
1700010I14RikQ7TPG0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
1700010I14RikQ7TPG0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
1700010I14RikQ7TPG0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
1700010I14RikQ7TPG0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
1700010I14RikQ7TPG0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
1700010I14RikQ7TPG0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
1700010I14RikQ7TPG0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
1700010I14RikQ7TPG0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
1700010I14RikQ7TPG0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
1700010I14RikQ7TPG0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
1700010I14RikQ7TPG0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
1700010I14RikQ7TPG0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
1700010I14RikQ7TPG0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
1700010I14RikQ7TPG0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms