Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNR6

Igsf21, Immunoglobulin superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf21Q7TNR6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igsf21Q7TNR6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Igsf21Q7TNR6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Igsf21Q7TNR6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Igsf21Q7TNR6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igsf21Q7TNR6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igsf21Q7TNR6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igsf21Q7TNR6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Igsf21Q7TNR6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igsf21Q7TNR6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igsf21Q7TNR6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igsf21Q7TNR6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igsf21Q7TNR6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igsf21Q7TNR6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igsf21Q7TNR6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igsf21Q7TNR6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igsf21Q7TNR6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igsf21Q7TNR6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igsf21Q7TNR6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Igsf21Q7TNR6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Igsf21Q7TNR6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Igsf21Q7TNR6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Igsf21Q7TNR6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Igsf21Q7TNR6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Igsf21Q7TNR6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Igsf21Q7TNR6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igsf21Q7TNR6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igsf21Q7TNR6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igsf21Q7TNR6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Igsf21Q7TNR6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Igsf21Q7TNR6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Igsf21Q7TNR6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igsf21Q7TNR6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igsf21Q7TNR6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igsf21Q7TNR6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igsf21Q7TNR6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Igsf21Q7TNR6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Igsf21Q7TNR6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Igsf21Q7TNR6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Igsf21Q7TNR6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Igsf21Q7TNR6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Igsf21Q7TNR6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igsf21Q7TNR6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Igsf21Q7TNR6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Igsf21Q7TNR6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Igsf21Q7TNR6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igsf21Q7TNR6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igsf21Q7TNR6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igsf21Q7TNR6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igsf21Q7TNR6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igsf21Q7TNR6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igsf21Q7TNR6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igsf21Q7TNR6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Igsf21Q7TNR6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igsf21Q7TNR6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igsf21Q7TNR6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Igsf21Q7TNR6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igsf21Q7TNR6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igsf21Q7TNR6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igsf21Q7TNR6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Igsf21Q7TNR6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Igsf21Q7TNR6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igsf21Q7TNR6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igsf21Q7TNR6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igsf21Q7TNR6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igsf21Q7TNR6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Igsf21Q7TNR6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Igsf21Q7TNR6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Igsf21Q7TNR6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Igsf21Q7TNR6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Igsf21Q7TNR6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igsf21Q7TNR6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igsf21Q7TNR6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igsf21Q7TNR6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igsf21Q7TNR6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igsf21Q7TNR6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Igsf21Q7TNR6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Igsf21Q7TNR6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Igsf21Q7TNR6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Igsf21Q7TNR6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Igsf21Q7TNR6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Igsf21Q7TNR6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Igsf21Q7TNR6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Igsf21Q7TNR6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Igsf21Q7TNR6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Igsf21Q7TNR6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Igsf21Q7TNR6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Igsf21Q7TNR6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Igsf21Q7TNR6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Igsf21Q7TNR6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Igsf21Q7TNR6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Igsf21Q7TNR6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Igsf21Q7TNR6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Igsf21Q7TNR6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Igsf21Q7TNR6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Igsf21Q7TNR6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Igsf21Q7TNR6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Igsf21Q7TNR6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Igsf21Q7TNR6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Igsf21Q7TNR6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms