Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmed3Q78IS1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmed3Q78IS1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmed3Q78IS1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmed3Q78IS1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmed3Q78IS1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmed3Q78IS1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmed3Q78IS1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmed3Q78IS1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmed3Q78IS1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmed3Q78IS1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmed3Q78IS1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmed3Q78IS1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmed3Q78IS1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed3Q78IS1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed3Q78IS1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed3Q78IS1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed3Q78IS1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmed3Q78IS1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmed3Q78IS1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmed3Q78IS1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmed3Q78IS1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmed3Q78IS1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmed3Q78IS1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Tmed3Q78IS1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmed3Q78IS1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmed3Q78IS1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmed3Q78IS1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmed3Q78IS1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmed3Q78IS1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmed3Q78IS1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmed3Q78IS1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmed3Q78IS1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmed3Q78IS1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmed3Q78IS1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmed3Q78IS1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmed3Q78IS1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmed3Q78IS1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmed3Q78IS1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmed3Q78IS1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmed3Q78IS1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmed3Q78IS1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmed3Q78IS1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed3Q78IS1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed3Q78IS1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed3Q78IS1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed3Q78IS1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed3Q78IS1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed3Q78IS1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed3Q78IS1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed3Q78IS1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed3Q78IS1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmed3Q78IS1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmed3Q78IS1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmed3Q78IS1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmed3Q78IS1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmed3Q78IS1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed3Q78IS1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed3Q78IS1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed3Q78IS1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmed3Q78IS1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmed3Q78IS1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmed3Q78IS1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed3Q78IS1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed3Q78IS1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed3Q78IS1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed3Q78IS1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed3Q78IS1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed3Q78IS1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed3Q78IS1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed3Q78IS1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed3Q78IS1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed3Q78IS1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed3Q78IS1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed3Q78IS1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmed3Q78IS1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed3Q78IS1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed3Q78IS1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed3Q78IS1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed3Q78IS1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed3Q78IS1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed3Q78IS1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed3Q78IS1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed3Q78IS1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed3Q78IS1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed3Q78IS1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed3Q78IS1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed3Q78IS1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed3Q78IS1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed3Q78IS1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed3Q78IS1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed3Q78IS1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed3Q78IS1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed3Q78IS1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed3Q78IS1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed3Q78IS1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed3Q78IS1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed3Q78IS1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed3Q78IS1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed3Q78IS1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms