Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl35Q6ZWV7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl35Q6ZWV7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl35Q6ZWV7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl35Q6ZWV7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl35Q6ZWV7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl35Q6ZWV7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl35Q6ZWV7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl35Q6ZWV7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl35Q6ZWV7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl35Q6ZWV7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl35Q6ZWV7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl35Q6ZWV7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl35Q6ZWV7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl35Q6ZWV7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl35Q6ZWV7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl35Q6ZWV7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl35Q6ZWV7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl35Q6ZWV7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl35Q6ZWV7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl35Q6ZWV7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl35Q6ZWV7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl35Q6ZWV7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl35Q6ZWV7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl35Q6ZWV7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl35Q6ZWV7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl35Q6ZWV7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl35Q6ZWV7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl35Q6ZWV7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl35Q6ZWV7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl35Q6ZWV7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl35Q6ZWV7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl35Q6ZWV7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl35Q6ZWV7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl35Q6ZWV7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl35Q6ZWV7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl35Q6ZWV7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl35Q6ZWV7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl35Q6ZWV7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl35Q6ZWV7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl35Q6ZWV7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl35Q6ZWV7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl35Q6ZWV7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl35Q6ZWV7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpl35Q6ZWV7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rpl35Q6ZWV7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl35Q6ZWV7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl35Q6ZWV7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl35Q6ZWV7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl35Q6ZWV7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl35Q6ZWV7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl35Q6ZWV7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl35Q6ZWV7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpl35Q6ZWV7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpl35Q6ZWV7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpl35Q6ZWV7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpl35Q6ZWV7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpl35Q6ZWV7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpl35Q6ZWV7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpl35Q6ZWV7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpl35Q6ZWV7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpl35Q6ZWV7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpl35Q6ZWV7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpl35Q6ZWV7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpl35Q6ZWV7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpl35Q6ZWV7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpl35Q6ZWV7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpl35Q6ZWV7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpl35Q6ZWV7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpl35Q6ZWV7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpl35Q6ZWV7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpl35Q6ZWV7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpl35Q6ZWV7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpl35Q6ZWV7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpl35Q6ZWV7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpl35Q6ZWV7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpl35Q6ZWV7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpl35Q6ZWV7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpl35Q6ZWV7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpl35Q6ZWV7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rpl35Q6ZWV7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpl35Q6ZWV7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpl35Q6ZWV7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpl35Q6ZWV7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpl35Q6ZWV7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpl35Q6ZWV7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpl35Q6ZWV7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpl35Q6ZWV7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpl35Q6ZWV7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpl35Q6ZWV7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpl35Q6ZWV7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpl35Q6ZWV7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpl35Q6ZWV7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpl35Q6ZWV7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpl35Q6ZWV7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpl35Q6ZWV7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpl35Q6ZWV7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpl35Q6ZWV7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpl35Q6ZWV7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpl35Q6ZWV7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms