Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ38

Cand1, Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cand1Q6ZQ38 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cand1Q6ZQ38 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cand1Q6ZQ38 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cand1Q6ZQ38 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cand1Q6ZQ38 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cand1Q6ZQ38 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cand1Q6ZQ38 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cand1Q6ZQ38 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cand1Q6ZQ38 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cand1Q6ZQ38 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cand1Q6ZQ38 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cand1Q6ZQ38 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cand1Q6ZQ38 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cand1Q6ZQ38 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cand1Q6ZQ38 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cand1Q6ZQ38 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cand1Q6ZQ38 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cand1Q6ZQ38 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cand1Q6ZQ38 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cand1Q6ZQ38 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cand1Q6ZQ38 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cand1Q6ZQ38 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cand1Q6ZQ38 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cand1Q6ZQ38 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cand1Q6ZQ38 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cand1Q6ZQ38 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cand1Q6ZQ38 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cand1Q6ZQ38 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cand1Q6ZQ38 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cand1Q6ZQ38 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cand1Q6ZQ38 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cand1Q6ZQ38 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cand1Q6ZQ38 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cand1Q6ZQ38 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cand1Q6ZQ38 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cand1Q6ZQ38 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cand1Q6ZQ38 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cand1Q6ZQ38 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cand1Q6ZQ38 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cand1Q6ZQ38 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cand1Q6ZQ38 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cand1Q6ZQ38 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cand1Q6ZQ38 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cand1Q6ZQ38 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cand1Q6ZQ38 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cand1Q6ZQ38 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cand1Q6ZQ38 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cand1Q6ZQ38 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cand1Q6ZQ38 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cand1Q6ZQ38 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cand1Q6ZQ38 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cand1Q6ZQ38 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cand1Q6ZQ38 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cand1Q6ZQ38 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cand1Q6ZQ38 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cand1Q6ZQ38 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cand1Q6ZQ38 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cand1Q6ZQ38 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cand1Q6ZQ38 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cand1Q6ZQ38 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cand1Q6ZQ38 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cand1Q6ZQ38 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cand1Q6ZQ38 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cand1Q6ZQ38 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cand1Q6ZQ38 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cand1Q6ZQ38 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cand1Q6ZQ38 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cand1Q6ZQ38 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cand1Q6ZQ38 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cand1Q6ZQ38 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cand1Q6ZQ38 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cand1Q6ZQ38 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cand1Q6ZQ38 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cand1Q6ZQ38 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cand1Q6ZQ38 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cand1Q6ZQ38 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cand1Q6ZQ38 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cand1Q6ZQ38 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cand1Q6ZQ38 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cand1Q6ZQ38 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cand1Q6ZQ38 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cand1Q6ZQ38 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cand1Q6ZQ38 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cand1Q6ZQ38 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cand1Q6ZQ38 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cand1Q6ZQ38 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cand1Q6ZQ38 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cand1Q6ZQ38 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cand1Q6ZQ38 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cand1Q6ZQ38 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cand1Q6ZQ38 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cand1Q6ZQ38 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cand1Q6ZQ38 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cand1Q6ZQ38 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cand1Q6ZQ38 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cand1Q6ZQ38 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cand1Q6ZQ38 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cand1Q6ZQ38 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cand1Q6ZQ38 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cand1Q6ZQ38 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms