Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx6Q6P8X1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx6Q6P8X1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx6Q6P8X1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx6Q6P8X1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx6Q6P8X1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx6Q6P8X1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx6Q6P8X1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx6Q6P8X1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx6Q6P8X1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx6Q6P8X1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx6Q6P8X1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx6Q6P8X1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx6Q6P8X1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx6Q6P8X1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx6Q6P8X1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx6Q6P8X1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx6Q6P8X1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx6Q6P8X1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx6Q6P8X1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx6Q6P8X1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx6Q6P8X1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx6Q6P8X1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx6Q6P8X1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx6Q6P8X1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx6Q6P8X1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx6Q6P8X1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx6Q6P8X1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx6Q6P8X1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx6Q6P8X1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx6Q6P8X1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx6Q6P8X1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx6Q6P8X1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx6Q6P8X1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx6Q6P8X1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx6Q6P8X1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx6Q6P8X1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx6Q6P8X1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx6Q6P8X1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx6Q6P8X1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx6Q6P8X1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx6Q6P8X1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx6Q6P8X1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx6Q6P8X1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx6Q6P8X1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx6Q6P8X1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx6Q6P8X1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx6Q6P8X1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx6Q6P8X1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx6Q6P8X1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx6Q6P8X1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx6Q6P8X1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx6Q6P8X1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snx6Q6P8X1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx6Q6P8X1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx6Q6P8X1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx6Q6P8X1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx6Q6P8X1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx6Q6P8X1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx6Q6P8X1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx6Q6P8X1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx6Q6P8X1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx6Q6P8X1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx6Q6P8X1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Snx6Q6P8X1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx6Q6P8X1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx6Q6P8X1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx6Q6P8X1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx6Q6P8X1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx6Q6P8X1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx6Q6P8X1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx6Q6P8X1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx6Q6P8X1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx6Q6P8X1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx6Q6P8X1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx6Q6P8X1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx6Q6P8X1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx6Q6P8X1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx6Q6P8X1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx6Q6P8X1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx6Q6P8X1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx6Q6P8X1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx6Q6P8X1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx6Q6P8X1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx6Q6P8X1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx6Q6P8X1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx6Q6P8X1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx6Q6P8X1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Snx6Q6P8X1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snx6Q6P8X1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx6Q6P8X1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx6Q6P8X1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx6Q6P8X1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx6Q6P8X1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx6Q6P8X1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx6Q6P8X1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx6Q6P8X1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx6Q6P8X1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx6Q6P8X1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx6Q6P8X1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms