Protein–RNA interactions for Protein: Q6P205

Xlr3b, X-linked lymphocyte-regulated protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr3bQ6P205 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xlr3bQ6P205 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xlr3bQ6P205 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xlr3bQ6P205 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xlr3bQ6P205 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xlr3bQ6P205 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Xlr3bQ6P205 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Xlr3bQ6P205 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Xlr3bQ6P205 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Xlr3bQ6P205 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Xlr3bQ6P205 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Xlr3bQ6P205 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Xlr3bQ6P205 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Xlr3bQ6P205 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Xlr3bQ6P205 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Xlr3bQ6P205 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Xlr3bQ6P205 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Xlr3bQ6P205 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Xlr3bQ6P205 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Xlr3bQ6P205 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Xlr3bQ6P205 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Xlr3bQ6P205 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Xlr3bQ6P205 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Xlr3bQ6P205 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Xlr3bQ6P205 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Xlr3bQ6P205 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Xlr3bQ6P205 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Xlr3bQ6P205 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Xlr3bQ6P205 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xlr3bQ6P205 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xlr3bQ6P205 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xlr3bQ6P205 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xlr3bQ6P205 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xlr3bQ6P205 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Xlr3bQ6P205 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Xlr3bQ6P205 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Xlr3bQ6P205 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Xlr3bQ6P205 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Xlr3bQ6P205 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Xlr3bQ6P205 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Xlr3bQ6P205 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Xlr3bQ6P205 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Xlr3bQ6P205 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Xlr3bQ6P205 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Xlr3bQ6P205 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Xlr3bQ6P205 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Xlr3bQ6P205 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Xlr3bQ6P205 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Xlr3bQ6P205 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Xlr3bQ6P205 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Xlr3bQ6P205 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Xlr3bQ6P205 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Xlr3bQ6P205 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xlr3bQ6P205 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xlr3bQ6P205 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xlr3bQ6P205 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xlr3bQ6P205 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xlr3bQ6P205 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Xlr3bQ6P205 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Xlr3bQ6P205 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Xlr3bQ6P205 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xlr3bQ6P205 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xlr3bQ6P205 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xlr3bQ6P205 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xlr3bQ6P205 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xlr3bQ6P205 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xlr3bQ6P205 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xlr3bQ6P205 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xlr3bQ6P205 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xlr3bQ6P205 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xlr3bQ6P205 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xlr3bQ6P205 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xlr3bQ6P205 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Xlr3bQ6P205 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xlr3bQ6P205 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Xlr3bQ6P205 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xlr3bQ6P205 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xlr3bQ6P205 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xlr3bQ6P205 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xlr3bQ6P205 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Xlr3bQ6P205 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xlr3bQ6P205 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xlr3bQ6P205 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xlr3bQ6P205 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xlr3bQ6P205 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xlr3bQ6P205 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xlr3bQ6P205 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xlr3bQ6P205 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xlr3bQ6P205 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xlr3bQ6P205 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xlr3bQ6P205 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xlr3bQ6P205 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xlr3bQ6P205 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xlr3bQ6P205 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xlr3bQ6P205 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xlr3bQ6P205 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Xlr3bQ6P205 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xlr3bQ6P205 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xlr3bQ6P205 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xlr3bQ6P205 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms