Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otud6aQ6IE21 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otud6aQ6IE21 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Otud6aQ6IE21 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Otud6aQ6IE21 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Otud6aQ6IE21 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otud6aQ6IE21 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otud6aQ6IE21 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otud6aQ6IE21 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otud6aQ6IE21 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otud6aQ6IE21 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otud6aQ6IE21 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otud6aQ6IE21 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otud6aQ6IE21 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otud6aQ6IE21 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otud6aQ6IE21 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otud6aQ6IE21 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otud6aQ6IE21 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otud6aQ6IE21 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Otud6aQ6IE21 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Otud6aQ6IE21 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Otud6aQ6IE21 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Otud6aQ6IE21 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Otud6aQ6IE21 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Otud6aQ6IE21 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Otud6aQ6IE21 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Otud6aQ6IE21 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Otud6aQ6IE21 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Otud6aQ6IE21 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Otud6aQ6IE21 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Otud6aQ6IE21 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Otud6aQ6IE21 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Otud6aQ6IE21 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Otud6aQ6IE21 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Otud6aQ6IE21 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otud6aQ6IE21 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otud6aQ6IE21 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otud6aQ6IE21 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otud6aQ6IE21 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud6aQ6IE21 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud6aQ6IE21 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud6aQ6IE21 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud6aQ6IE21 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Otud6aQ6IE21 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Otud6aQ6IE21 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Otud6aQ6IE21 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Otud6aQ6IE21 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Otud6aQ6IE21 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Otud6aQ6IE21 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otud6aQ6IE21 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otud6aQ6IE21 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otud6aQ6IE21 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otud6aQ6IE21 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud6aQ6IE21 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud6aQ6IE21 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud6aQ6IE21 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud6aQ6IE21 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud6aQ6IE21 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud6aQ6IE21 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud6aQ6IE21 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud6aQ6IE21 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud6aQ6IE21 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud6aQ6IE21 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Otud6aQ6IE21 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud6aQ6IE21 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud6aQ6IE21 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otud6aQ6IE21 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otud6aQ6IE21 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otud6aQ6IE21 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otud6aQ6IE21 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud6aQ6IE21 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud6aQ6IE21 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud6aQ6IE21 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud6aQ6IE21 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud6aQ6IE21 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud6aQ6IE21 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud6aQ6IE21 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud6aQ6IE21 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud6aQ6IE21 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud6aQ6IE21 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud6aQ6IE21 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud6aQ6IE21 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud6aQ6IE21 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud6aQ6IE21 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud6aQ6IE21 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud6aQ6IE21 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud6aQ6IE21 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud6aQ6IE21 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud6aQ6IE21 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud6aQ6IE21 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud6aQ6IE21 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud6aQ6IE21 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud6aQ6IE21 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud6aQ6IE21 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otud6aQ6IE21 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otud6aQ6IE21 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otud6aQ6IE21 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otud6aQ6IE21 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otud6aQ6IE21 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otud6aQ6IE21 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms