Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmcc1Q69ZZ6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmcc1Q69ZZ6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmcc1Q69ZZ6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmcc1Q69ZZ6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmcc1Q69ZZ6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmcc1Q69ZZ6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmcc1Q69ZZ6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmcc1Q69ZZ6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmcc1Q69ZZ6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmcc1Q69ZZ6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmcc1Q69ZZ6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmcc1Q69ZZ6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmcc1Q69ZZ6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmcc1Q69ZZ6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmcc1Q69ZZ6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmcc1Q69ZZ6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmcc1Q69ZZ6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmcc1Q69ZZ6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmcc1Q69ZZ6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmcc1Q69ZZ6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmcc1Q69ZZ6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmcc1Q69ZZ6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmcc1Q69ZZ6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmcc1Q69ZZ6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmcc1Q69ZZ6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmcc1Q69ZZ6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmcc1Q69ZZ6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmcc1Q69ZZ6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmcc1Q69ZZ6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmcc1Q69ZZ6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmcc1Q69ZZ6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmcc1Q69ZZ6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmcc1Q69ZZ6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmcc1Q69ZZ6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmcc1Q69ZZ6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmcc1Q69ZZ6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmcc1Q69ZZ6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmcc1Q69ZZ6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmcc1Q69ZZ6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmcc1Q69ZZ6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmcc1Q69ZZ6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmcc1Q69ZZ6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmcc1Q69ZZ6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmcc1Q69ZZ6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmcc1Q69ZZ6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmcc1Q69ZZ6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmcc1Q69ZZ6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmcc1Q69ZZ6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmcc1Q69ZZ6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmcc1Q69ZZ6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmcc1Q69ZZ6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmcc1Q69ZZ6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmcc1Q69ZZ6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmcc1Q69ZZ6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmcc1Q69ZZ6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmcc1Q69ZZ6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmcc1Q69ZZ6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmcc1Q69ZZ6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmcc1Q69ZZ6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmcc1Q69ZZ6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmcc1Q69ZZ6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmcc1Q69ZZ6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmcc1Q69ZZ6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmcc1Q69ZZ6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmcc1Q69ZZ6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmcc1Q69ZZ6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmcc1Q69ZZ6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmcc1Q69ZZ6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmcc1Q69ZZ6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmcc1Q69ZZ6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmcc1Q69ZZ6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmcc1Q69ZZ6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmcc1Q69ZZ6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmcc1Q69ZZ6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmcc1Q69ZZ6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmcc1Q69ZZ6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmcc1Q69ZZ6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmcc1Q69ZZ6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmcc1Q69ZZ6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmcc1Q69ZZ6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmcc1Q69ZZ6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmcc1Q69ZZ6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmcc1Q69ZZ6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmcc1Q69ZZ6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmcc1Q69ZZ6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmcc1Q69ZZ6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmcc1Q69ZZ6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmcc1Q69ZZ6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmcc1Q69ZZ6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmcc1Q69ZZ6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmcc1Q69ZZ6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmcc1Q69ZZ6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmcc1Q69ZZ6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmcc1Q69ZZ6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms