Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF6

Begain, Brain-enriched guanylate kinase-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BegainQ68EF6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BegainQ68EF6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BegainQ68EF6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BegainQ68EF6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BegainQ68EF6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BegainQ68EF6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BegainQ68EF6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BegainQ68EF6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BegainQ68EF6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BegainQ68EF6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BegainQ68EF6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BegainQ68EF6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BegainQ68EF6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BegainQ68EF6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BegainQ68EF6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BegainQ68EF6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BegainQ68EF6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BegainQ68EF6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BegainQ68EF6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BegainQ68EF6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BegainQ68EF6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BegainQ68EF6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BegainQ68EF6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BegainQ68EF6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BegainQ68EF6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BegainQ68EF6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BegainQ68EF6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BegainQ68EF6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BegainQ68EF6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BegainQ68EF6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BegainQ68EF6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BegainQ68EF6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BegainQ68EF6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BegainQ68EF6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BegainQ68EF6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BegainQ68EF6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BegainQ68EF6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BegainQ68EF6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BegainQ68EF6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BegainQ68EF6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BegainQ68EF6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BegainQ68EF6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BegainQ68EF6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BegainQ68EF6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BegainQ68EF6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BegainQ68EF6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BegainQ68EF6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BegainQ68EF6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BegainQ68EF6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BegainQ68EF6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BegainQ68EF6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BegainQ68EF6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BegainQ68EF6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BegainQ68EF6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BegainQ68EF6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BegainQ68EF6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BegainQ68EF6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BegainQ68EF6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BegainQ68EF6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BegainQ68EF6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BegainQ68EF6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BegainQ68EF6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BegainQ68EF6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BegainQ68EF6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BegainQ68EF6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BegainQ68EF6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BegainQ68EF6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BegainQ68EF6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BegainQ68EF6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BegainQ68EF6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BegainQ68EF6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BegainQ68EF6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BegainQ68EF6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BegainQ68EF6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BegainQ68EF6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BegainQ68EF6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BegainQ68EF6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BegainQ68EF6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BegainQ68EF6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BegainQ68EF6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BegainQ68EF6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BegainQ68EF6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BegainQ68EF6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BegainQ68EF6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BegainQ68EF6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BegainQ68EF6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BegainQ68EF6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BegainQ68EF6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BegainQ68EF6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BegainQ68EF6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BegainQ68EF6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BegainQ68EF6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BegainQ68EF6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BegainQ68EF6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BegainQ68EF6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BegainQ68EF6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
BegainQ68EF6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BegainQ68EF6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BegainQ68EF6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BegainQ68EF6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms