Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Q66JV7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Q66JV7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Q66JV7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Q66JV7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Q66JV7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Q66JV7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Q66JV7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Q66JV7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Q66JV7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Q66JV7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Q66JV7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Q66JV7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q66JV7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q66JV7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q66JV7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q66JV7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q66JV7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q66JV7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q66JV7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q66JV7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Q66JV7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Q66JV7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q66JV7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Q66JV7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Q66JV7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Q66JV7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Q66JV7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Q66JV7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Q66JV7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Q66JV7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Q66JV7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Q66JV7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Q66JV7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Q66JV7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q66JV7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q66JV7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q66JV7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q66JV7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q66JV7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q66JV7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Q66JV7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Q66JV7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Q66JV7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Q66JV7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Q66JV7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Q66JV7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Q66JV7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Q66JV7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Q66JV7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Q66JV7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Q66JV7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q66JV7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Q66JV7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q66JV7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q66JV7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q66JV7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q66JV7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q66JV7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q66JV7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q66JV7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q66JV7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q66JV7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q66JV7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Q66JV7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q66JV7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q66JV7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q66JV7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q66JV7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Q66JV7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q66JV7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q66JV7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q66JV7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q66JV7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q66JV7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q66JV7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q66JV7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q66JV7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q66JV7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q66JV7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q66JV7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Q66JV7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q66JV7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q66JV7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q66JV7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q66JV7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q66JV7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q66JV7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q66JV7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q66JV7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Q66JV7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Q66JV7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Q66JV7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Q66JV7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Q66JV7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Q66JV7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Q66JV7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Q66JV7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q66JV7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q66JV7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms