Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pou4f3Q63955 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pou4f3Q63955 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pou4f3Q63955 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pou4f3Q63955 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pou4f3Q63955 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pou4f3Q63955 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pou4f3Q63955 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pou4f3Q63955 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pou4f3Q63955 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pou4f3Q63955 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pou4f3Q63955 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pou4f3Q63955 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pou4f3Q63955 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pou4f3Q63955 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pou4f3Q63955 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pou4f3Q63955 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pou4f3Q63955 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pou4f3Q63955 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pou4f3Q63955 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pou4f3Q63955 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pou4f3Q63955 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pou4f3Q63955 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pou4f3Q63955 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pou4f3Q63955 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pou4f3Q63955 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pou4f3Q63955 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou4f3Q63955 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou4f3Q63955 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou4f3Q63955 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou4f3Q63955 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pou4f3Q63955 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pou4f3Q63955 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pou4f3Q63955 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pou4f3Q63955 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pou4f3Q63955 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pou4f3Q63955 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pou4f3Q63955 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pou4f3Q63955 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pou4f3Q63955 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pou4f3Q63955 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pou4f3Q63955 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pou4f3Q63955 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pou4f3Q63955 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pou4f3Q63955 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pou4f3Q63955 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pou4f3Q63955 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pou4f3Q63955 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pou4f3Q63955 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pou4f3Q63955 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pou4f3Q63955 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pou4f3Q63955 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pou4f3Q63955 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pou4f3Q63955 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pou4f3Q63955 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pou4f3Q63955 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pou4f3Q63955 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pou4f3Q63955 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pou4f3Q63955 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pou4f3Q63955 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pou4f3Q63955 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pou4f3Q63955 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pou4f3Q63955 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pou4f3Q63955 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pou4f3Q63955 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pou4f3Q63955 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pou4f3Q63955 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pou4f3Q63955 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pou4f3Q63955 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pou4f3Q63955 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pou4f3Q63955 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pou4f3Q63955 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pou4f3Q63955 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pou4f3Q63955 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pou4f3Q63955 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pou4f3Q63955 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pou4f3Q63955 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pou4f3Q63955 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pou4f3Q63955 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pou4f3Q63955 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pou4f3Q63955 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pou4f3Q63955 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pou4f3Q63955 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pou4f3Q63955 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pou4f3Q63955 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pou4f3Q63955 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pou4f3Q63955 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pou4f3Q63955 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pou4f3Q63955 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pou4f3Q63955 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pou4f3Q63955 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pou4f3Q63955 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pou4f3Q63955 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pou4f3Q63955 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pou4f3Q63955 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pou4f3Q63955 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pou4f3Q63955 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pou4f3Q63955 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pou4f3Q63955 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pou4f3Q63955 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms