Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lcn4Q62472 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lcn4Q62472 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lcn4Q62472 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lcn4Q62472 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lcn4Q62472 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lcn4Q62472 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lcn4Q62472 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lcn4Q62472 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lcn4Q62472 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lcn4Q62472 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lcn4Q62472 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lcn4Q62472 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lcn4Q62472 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lcn4Q62472 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lcn4Q62472 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lcn4Q62472 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lcn4Q62472 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lcn4Q62472 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lcn4Q62472 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lcn4Q62472 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lcn4Q62472 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lcn4Q62472 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lcn4Q62472 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lcn4Q62472 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lcn4Q62472 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lcn4Q62472 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lcn4Q62472 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lcn4Q62472 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lcn4Q62472 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lcn4Q62472 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lcn4Q62472 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lcn4Q62472 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lcn4Q62472 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lcn4Q62472 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lcn4Q62472 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lcn4Q62472 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lcn4Q62472 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lcn4Q62472 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lcn4Q62472 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lcn4Q62472 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lcn4Q62472 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lcn4Q62472 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lcn4Q62472 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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