Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp1Q62442 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp1Q62442 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vamp1Q62442 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vamp1Q62442 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp1Q62442 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp1Q62442 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp1Q62442 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp1Q62442 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp1Q62442 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp1Q62442 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp1Q62442 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp1Q62442 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp1Q62442 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp1Q62442 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp1Q62442 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp1Q62442 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp1Q62442 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp1Q62442 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp1Q62442 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp1Q62442 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp1Q62442 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp1Q62442 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp1Q62442 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp1Q62442 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp1Q62442 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp1Q62442 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp1Q62442 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp1Q62442 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp1Q62442 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp1Q62442 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp1Q62442 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp1Q62442 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp1Q62442 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp1Q62442 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp1Q62442 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp1Q62442 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vamp1Q62442 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vamp1Q62442 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp1Q62442 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp1Q62442 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vamp1Q62442 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vamp1Q62442 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp1Q62442 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp1Q62442 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp1Q62442 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vamp1Q62442 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vamp1Q62442 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vamp1Q62442 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vamp1Q62442 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vamp1Q62442 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp1Q62442 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp1Q62442 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp1Q62442 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp1Q62442 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp1Q62442 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp1Q62442 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp1Q62442 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp1Q62442 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp1Q62442 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp1Q62442 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp1Q62442 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vamp1Q62442 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vamp1Q62442 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vamp1Q62442 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vamp1Q62442 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vamp1Q62442 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vamp1Q62442 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vamp1Q62442 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vamp1Q62442 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vamp1Q62442 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vamp1Q62442 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vamp1Q62442 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vamp1Q62442 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vamp1Q62442 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vamp1Q62442 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vamp1Q62442 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vamp1Q62442 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vamp1Q62442 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vamp1Q62442 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vamp1Q62442 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vamp1Q62442 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vamp1Q62442 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vamp1Q62442 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vamp1Q62442 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vamp1Q62442 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vamp1Q62442 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vamp1Q62442 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vamp1Q62442 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Vamp1Q62442 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp1Q62442 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp1Q62442 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp1Q62442 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp1Q62442 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp1Q62442 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp1Q62442 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp1Q62442 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp1Q62442 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp1Q62442 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vamp1Q62442 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms