Protein–RNA interactions for Protein: Q62191

Trim21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim21Q62191 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim21Q62191 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim21Q62191 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim21Q62191 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim21Q62191 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim21Q62191 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim21Q62191 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim21Q62191 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim21Q62191 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim21Q62191 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim21Q62191 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim21Q62191 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim21Q62191 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim21Q62191 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim21Q62191 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim21Q62191 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim21Q62191 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim21Q62191 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim21Q62191 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim21Q62191 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim21Q62191 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim21Q62191 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim21Q62191 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim21Q62191 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim21Q62191 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim21Q62191 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim21Q62191 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim21Q62191 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim21Q62191 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim21Q62191 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim21Q62191 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim21Q62191 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim21Q62191 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim21Q62191 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim21Q62191 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim21Q62191 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim21Q62191 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim21Q62191 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim21Q62191 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim21Q62191 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim21Q62191 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim21Q62191 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim21Q62191 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim21Q62191 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim21Q62191 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim21Q62191 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim21Q62191 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim21Q62191 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim21Q62191 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim21Q62191 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim21Q62191 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim21Q62191 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim21Q62191 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim21Q62191 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim21Q62191 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim21Q62191 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim21Q62191 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim21Q62191 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim21Q62191 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim21Q62191 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim21Q62191 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim21Q62191 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim21Q62191 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim21Q62191 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim21Q62191 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim21Q62191 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim21Q62191 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim21Q62191 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim21Q62191 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim21Q62191 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim21Q62191 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim21Q62191 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim21Q62191 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim21Q62191 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim21Q62191 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim21Q62191 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim21Q62191 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim21Q62191 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim21Q62191 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim21Q62191 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim21Q62191 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim21Q62191 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim21Q62191 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim21Q62191 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim21Q62191 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim21Q62191 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim21Q62191 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim21Q62191 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim21Q62191 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim21Q62191 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim21Q62191 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim21Q62191 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim21Q62191 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim21Q62191 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim21Q62191 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim21Q62191 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim21Q62191 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim21Q62191 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim21Q62191 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim21Q62191 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms