Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phox2aQ62066 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phox2aQ62066 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phox2aQ62066 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phox2aQ62066 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phox2aQ62066 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phox2aQ62066 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phox2aQ62066 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phox2aQ62066 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phox2aQ62066 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phox2aQ62066 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phox2aQ62066 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phox2aQ62066 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phox2aQ62066 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phox2aQ62066 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phox2aQ62066 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phox2aQ62066 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phox2aQ62066 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phox2aQ62066 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phox2aQ62066 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phox2aQ62066 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phox2aQ62066 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phox2aQ62066 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Phox2aQ62066 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phox2aQ62066 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phox2aQ62066 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phox2aQ62066 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phox2aQ62066 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phox2aQ62066 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phox2aQ62066 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phox2aQ62066 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phox2aQ62066 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phox2aQ62066 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phox2aQ62066 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phox2aQ62066 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phox2aQ62066 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phox2aQ62066 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phox2aQ62066 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phox2aQ62066 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phox2aQ62066 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phox2aQ62066 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phox2aQ62066 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phox2aQ62066 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phox2aQ62066 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phox2aQ62066 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phox2aQ62066 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phox2aQ62066 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phox2aQ62066 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phox2aQ62066 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phox2aQ62066 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phox2aQ62066 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phox2aQ62066 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phox2aQ62066 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phox2aQ62066 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phox2aQ62066 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phox2aQ62066 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phox2aQ62066 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phox2aQ62066 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phox2aQ62066 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Phox2aQ62066 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Phox2aQ62066 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Phox2aQ62066 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Phox2aQ62066 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Phox2aQ62066 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Phox2aQ62066 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Phox2aQ62066 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phox2aQ62066 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phox2aQ62066 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phox2aQ62066 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phox2aQ62066 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phox2aQ62066 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phox2aQ62066 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phox2aQ62066 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phox2aQ62066 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phox2aQ62066 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phox2aQ62066 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phox2aQ62066 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Phox2aQ62066 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Phox2aQ62066 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Phox2aQ62066 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Phox2aQ62066 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Phox2aQ62066 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Phox2aQ62066 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Phox2aQ62066 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Phox2aQ62066 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phox2aQ62066 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phox2aQ62066 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phox2aQ62066 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phox2aQ62066 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Phox2aQ62066 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Phox2aQ62066 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Phox2aQ62066 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Phox2aQ62066 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phox2aQ62066 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phox2aQ62066 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phox2aQ62066 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phox2aQ62066 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Phox2aQ62066 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Phox2aQ62066 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Phox2aQ62066 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms