Protein–RNA interactions for Protein: Q61704

Itih3, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itih3Q61704 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itih3Q61704 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itih3Q61704 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itih3Q61704 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itih3Q61704 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itih3Q61704 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itih3Q61704 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itih3Q61704 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itih3Q61704 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itih3Q61704 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itih3Q61704 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itih3Q61704 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itih3Q61704 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itih3Q61704 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itih3Q61704 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itih3Q61704 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itih3Q61704 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itih3Q61704 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itih3Q61704 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itih3Q61704 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Itih3Q61704 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itih3Q61704 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itih3Q61704 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itih3Q61704 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Itih3Q61704 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itih3Q61704 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itih3Q61704 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itih3Q61704 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itih3Q61704 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itih3Q61704 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itih3Q61704 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itih3Q61704 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itih3Q61704 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itih3Q61704 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itih3Q61704 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itih3Q61704 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itih3Q61704 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itih3Q61704 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itih3Q61704 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itih3Q61704 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itih3Q61704 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itih3Q61704 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Itih3Q61704 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itih3Q61704 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itih3Q61704 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itih3Q61704 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itih3Q61704 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itih3Q61704 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itih3Q61704 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itih3Q61704 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itih3Q61704 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itih3Q61704 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itih3Q61704 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itih3Q61704 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itih3Q61704 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itih3Q61704 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Itih3Q61704 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itih3Q61704 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itih3Q61704 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itih3Q61704 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Itih3Q61704 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Itih3Q61704 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itih3Q61704 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itih3Q61704 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itih3Q61704 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itih3Q61704 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itih3Q61704 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itih3Q61704 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itih3Q61704 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itih3Q61704 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itih3Q61704 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itih3Q61704 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itih3Q61704 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Itih3Q61704 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itih3Q61704 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itih3Q61704 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Itih3Q61704 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Itih3Q61704 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Itih3Q61704 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itih3Q61704 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itih3Q61704 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itih3Q61704 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itih3Q61704 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itih3Q61704 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itih3Q61704 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itih3Q61704 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itih3Q61704 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itih3Q61704 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itih3Q61704 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itih3Q61704 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itih3Q61704 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Itih3Q61704 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itih3Q61704 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itih3Q61704 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itih3Q61704 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Itih3Q61704 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itih3Q61704 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itih3Q61704 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itih3Q61704 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itih3Q61704 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms