Protein–RNA interactions for Protein: Q61656

Ddx5, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx5Q61656 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx5Q61656 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx5Q61656 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx5Q61656 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx5Q61656 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx5Q61656 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx5Q61656 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx5Q61656 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx5Q61656 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx5Q61656 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx5Q61656 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx5Q61656 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx5Q61656 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx5Q61656 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx5Q61656 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx5Q61656 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx5Q61656 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx5Q61656 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx5Q61656 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx5Q61656 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx5Q61656 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx5Q61656 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx5Q61656 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ddx5Q61656 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ddx5Q61656 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx5Q61656 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx5Q61656 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx5Q61656 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx5Q61656 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx5Q61656 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx5Q61656 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx5Q61656 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx5Q61656 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx5Q61656 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx5Q61656 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx5Q61656 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx5Q61656 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx5Q61656 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx5Q61656 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx5Q61656 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx5Q61656 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx5Q61656 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx5Q61656 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ddx5Q61656 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ddx5Q61656 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx5Q61656 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx5Q61656 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx5Q61656 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx5Q61656 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx5Q61656 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx5Q61656 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx5Q61656 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx5Q61656 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx5Q61656 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx5Q61656 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx5Q61656 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx5Q61656 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx5Q61656 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ddx5Q61656 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx5Q61656 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx5Q61656 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx5Q61656 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx5Q61656 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx5Q61656 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx5Q61656 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx5Q61656 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx5Q61656 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx5Q61656 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx5Q61656 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx5Q61656 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx5Q61656 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx5Q61656 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx5Q61656 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx5Q61656 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx5Q61656 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx5Q61656 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx5Q61656 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx5Q61656 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx5Q61656 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx5Q61656 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx5Q61656 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx5Q61656 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx5Q61656 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx5Q61656 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx5Q61656 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx5Q61656 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx5Q61656 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx5Q61656 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx5Q61656 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Ddx5Q61656 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx5Q61656 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx5Q61656 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx5Q61656 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx5Q61656 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx5Q61656 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx5Q61656 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx5Q61656 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx5Q61656 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx5Q61656 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx5Q61656 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms