Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcd2Q61285 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcd2Q61285 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcd2Q61285 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcd2Q61285 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcd2Q61285 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcd2Q61285 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcd2Q61285 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcd2Q61285 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcd2Q61285 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcd2Q61285 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcd2Q61285 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcd2Q61285 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcd2Q61285 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcd2Q61285 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcd2Q61285 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcd2Q61285 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcd2Q61285 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcd2Q61285 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcd2Q61285 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcd2Q61285 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcd2Q61285 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcd2Q61285 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcd2Q61285 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Abcd2Q61285 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Abcd2Q61285 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Abcd2Q61285 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcd2Q61285 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcd2Q61285 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcd2Q61285 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcd2Q61285 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcd2Q61285 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcd2Q61285 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcd2Q61285 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcd2Q61285 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcd2Q61285 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcd2Q61285 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcd2Q61285 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcd2Q61285 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcd2Q61285 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcd2Q61285 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcd2Q61285 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcd2Q61285 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcd2Q61285 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcd2Q61285 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcd2Q61285 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcd2Q61285 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcd2Q61285 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcd2Q61285 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcd2Q61285 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcd2Q61285 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcd2Q61285 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcd2Q61285 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcd2Q61285 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcd2Q61285 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcd2Q61285 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcd2Q61285 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcd2Q61285 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcd2Q61285 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcd2Q61285 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcd2Q61285 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcd2Q61285 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcd2Q61285 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcd2Q61285 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcd2Q61285 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcd2Q61285 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcd2Q61285 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcd2Q61285 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcd2Q61285 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcd2Q61285 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcd2Q61285 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcd2Q61285 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcd2Q61285 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcd2Q61285 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcd2Q61285 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcd2Q61285 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcd2Q61285 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcd2Q61285 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Abcd2Q61285 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcd2Q61285 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcd2Q61285 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcd2Q61285 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcd2Q61285 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcd2Q61285 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcd2Q61285 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcd2Q61285 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcd2Q61285 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcd2Q61285 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcd2Q61285 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcd2Q61285 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcd2Q61285 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcd2Q61285 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcd2Q61285 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Abcd2Q61285 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcd2Q61285 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcd2Q61285 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcd2Q61285 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcd2Q61285 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcd2Q61285 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcd2Q61285 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms