Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Mre11Q61216 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Mre11Q61216 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Mre11Q61216 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Mre11Q61216 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Mre11Q61216 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Mre11Q61216 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Mre11Q61216 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Mre11Q61216 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Mre11Q61216 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Mre11Q61216 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Mre11Q61216 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Mre11Q61216 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Mre11Q61216 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Mre11Q61216 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Mre11Q61216 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Mre11Q61216 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Mre11Q61216 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Mre11Q61216 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Mre11Q61216 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Mre11Q61216 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Mre11Q61216 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Mre11Q61216 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Mre11Q61216 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Mre11Q61216 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Mre11Q61216 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Mre11Q61216 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Mre11Q61216 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Mre11Q61216 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Mre11Q61216 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Mre11Q61216 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Mre11Q61216 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Mre11Q61216 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Mre11Q61216 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Mre11Q61216 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Mre11Q61216 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Mre11Q61216 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Mre11Q61216 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Mre11Q61216 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Mre11Q61216 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Mre11Q61216 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Mre11Q61216 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Mre11Q61216 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Mre11Q61216 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Mre11Q61216 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Mre11Q61216 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Mre11Q61216 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Mre11Q61216 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Mre11Q61216 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Mre11Q61216 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Mre11Q61216 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Mre11Q61216 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Mre11Q61216 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Mre11Q61216 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Mre11Q61216 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Mre11Q61216 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Mre11Q61216 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Mre11Q61216 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Mre11Q61216 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Mre11Q61216 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Mre11Q61216 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Mre11Q61216 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Mre11Q61216 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Mre11Q61216 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Mre11Q61216 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Mre11Q61216 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Mre11Q61216 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Mre11Q61216 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mre11Q61216 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mre11Q61216 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mre11Q61216 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Mre11Q61216 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Mre11Q61216 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Mre11Q61216 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Mre11Q61216 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Mre11Q61216 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Mre11Q61216 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Mre11Q61216 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Mre11Q61216 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Mre11Q61216 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mre11Q61216 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Mre11Q61216 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Mre11Q61216 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Mre11Q61216 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Mre11Q61216 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Mre11Q61216 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Mre11Q61216 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mre11Q61216 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Mre11Q61216 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Mre11Q61216 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Mre11Q61216 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Mre11Q61216 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Mre11Q61216 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Mre11Q61216 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Mre11Q61216 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Mre11Q61216 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Mre11Q61216 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Mre11Q61216 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Mre11Q61216 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Mre11Q61216 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms