Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prpf4bQ61136 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prpf4bQ61136 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prpf4bQ61136 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Prpf4bQ61136 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prpf4bQ61136 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prpf4bQ61136 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prpf4bQ61136 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prpf4bQ61136 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prpf4bQ61136 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prpf4bQ61136 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prpf4bQ61136 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prpf4bQ61136 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prpf4bQ61136 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prpf4bQ61136 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prpf4bQ61136 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prpf4bQ61136 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prpf4bQ61136 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prpf4bQ61136 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prpf4bQ61136 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prpf4bQ61136 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prpf4bQ61136 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prpf4bQ61136 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prpf4bQ61136 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prpf4bQ61136 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prpf4bQ61136 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prpf4bQ61136 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prpf4bQ61136 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prpf4bQ61136 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prpf4bQ61136 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prpf4bQ61136 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prpf4bQ61136 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prpf4bQ61136 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prpf4bQ61136 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prpf4bQ61136 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prpf4bQ61136 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prpf4bQ61136 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prpf4bQ61136 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Prpf4bQ61136 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Prpf4bQ61136 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Prpf4bQ61136 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prpf4bQ61136 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prpf4bQ61136 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prpf4bQ61136 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Prpf4bQ61136 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Prpf4bQ61136 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prpf4bQ61136 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prpf4bQ61136 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prpf4bQ61136 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prpf4bQ61136 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prpf4bQ61136 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prpf4bQ61136 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prpf4bQ61136 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prpf4bQ61136 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Prpf4bQ61136 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prpf4bQ61136 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prpf4bQ61136 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prpf4bQ61136 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prpf4bQ61136 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prpf4bQ61136 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prpf4bQ61136 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prpf4bQ61136 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prpf4bQ61136 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prpf4bQ61136 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prpf4bQ61136 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prpf4bQ61136 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prpf4bQ61136 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prpf4bQ61136 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prpf4bQ61136 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Prpf4bQ61136 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prpf4bQ61136 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prpf4bQ61136 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prpf4bQ61136 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prpf4bQ61136 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prpf4bQ61136 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prpf4bQ61136 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prpf4bQ61136 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prpf4bQ61136 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prpf4bQ61136 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prpf4bQ61136 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prpf4bQ61136 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prpf4bQ61136 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prpf4bQ61136 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prpf4bQ61136 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Prpf4bQ61136 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prpf4bQ61136 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prpf4bQ61136 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prpf4bQ61136 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prpf4bQ61136 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prpf4bQ61136 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prpf4bQ61136 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prpf4bQ61136 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prpf4bQ61136 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prpf4bQ61136 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prpf4bQ61136 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prpf4bQ61136 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prpf4bQ61136 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prpf4bQ61136 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Prpf4bQ61136 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prpf4bQ61136 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms