Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI2

Slc44a5, Choline transporter-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a5Q5RJI2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc44a5Q5RJI2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc44a5Q5RJI2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc44a5Q5RJI2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc44a5Q5RJI2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc44a5Q5RJI2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc44a5Q5RJI2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc44a5Q5RJI2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc44a5Q5RJI2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc44a5Q5RJI2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc44a5Q5RJI2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc44a5Q5RJI2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc44a5Q5RJI2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc44a5Q5RJI2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc44a5Q5RJI2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc44a5Q5RJI2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc44a5Q5RJI2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc44a5Q5RJI2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc44a5Q5RJI2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc44a5Q5RJI2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc44a5Q5RJI2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc44a5Q5RJI2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc44a5Q5RJI2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc44a5Q5RJI2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc44a5Q5RJI2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc44a5Q5RJI2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc44a5Q5RJI2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc44a5Q5RJI2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc44a5Q5RJI2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc44a5Q5RJI2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc44a5Q5RJI2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc44a5Q5RJI2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc44a5Q5RJI2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc44a5Q5RJI2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc44a5Q5RJI2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc44a5Q5RJI2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc44a5Q5RJI2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc44a5Q5RJI2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc44a5Q5RJI2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc44a5Q5RJI2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc44a5Q5RJI2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc44a5Q5RJI2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc44a5Q5RJI2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc44a5Q5RJI2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc44a5Q5RJI2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc44a5Q5RJI2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc44a5Q5RJI2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc44a5Q5RJI2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc44a5Q5RJI2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc44a5Q5RJI2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc44a5Q5RJI2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc44a5Q5RJI2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc44a5Q5RJI2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc44a5Q5RJI2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc44a5Q5RJI2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc44a5Q5RJI2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a5Q5RJI2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a5Q5RJI2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a5Q5RJI2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a5Q5RJI2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a5Q5RJI2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc44a5Q5RJI2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc44a5Q5RJI2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc44a5Q5RJI2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc44a5Q5RJI2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc44a5Q5RJI2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc44a5Q5RJI2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc44a5Q5RJI2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc44a5Q5RJI2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc44a5Q5RJI2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc44a5Q5RJI2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc44a5Q5RJI2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc44a5Q5RJI2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc44a5Q5RJI2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc44a5Q5RJI2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc44a5Q5RJI2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a5Q5RJI2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a5Q5RJI2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a5Q5RJI2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a5Q5RJI2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a5Q5RJI2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc44a5Q5RJI2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc44a5Q5RJI2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc44a5Q5RJI2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc44a5Q5RJI2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc44a5Q5RJI2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc44a5Q5RJI2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc44a5Q5RJI2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc44a5Q5RJI2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc44a5Q5RJI2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc44a5Q5RJI2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Slc44a5Q5RJI2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc44a5Q5RJI2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc44a5Q5RJI2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc44a5Q5RJI2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc44a5Q5RJI2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc44a5Q5RJI2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc44a5Q5RJI2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc44a5Q5RJI2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc44a5Q5RJI2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms