Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bhlha9Q5RJB0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bhlha9Q5RJB0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bhlha9Q5RJB0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bhlha9Q5RJB0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bhlha9Q5RJB0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bhlha9Q5RJB0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Bhlha9Q5RJB0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bhlha9Q5RJB0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bhlha9Q5RJB0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bhlha9Q5RJB0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bhlha9Q5RJB0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Bhlha9Q5RJB0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bhlha9Q5RJB0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bhlha9Q5RJB0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Bhlha9Q5RJB0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bhlha9Q5RJB0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bhlha9Q5RJB0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bhlha9Q5RJB0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bhlha9Q5RJB0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bhlha9Q5RJB0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bhlha9Q5RJB0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Bhlha9Q5RJB0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bhlha9Q5RJB0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bhlha9Q5RJB0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bhlha9Q5RJB0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bhlha9Q5RJB0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bhlha9Q5RJB0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bhlha9Q5RJB0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bhlha9Q5RJB0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bhlha9Q5RJB0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bhlha9Q5RJB0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bhlha9Q5RJB0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Bhlha9Q5RJB0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Bhlha9Q5RJB0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Bhlha9Q5RJB0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bhlha9Q5RJB0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bhlha9Q5RJB0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bhlha9Q5RJB0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bhlha9Q5RJB0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bhlha9Q5RJB0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bhlha9Q5RJB0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bhlha9Q5RJB0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bhlha9Q5RJB0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bhlha9Q5RJB0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bhlha9Q5RJB0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bhlha9Q5RJB0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bhlha9Q5RJB0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bhlha9Q5RJB0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bhlha9Q5RJB0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bhlha9Q5RJB0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Bhlha9Q5RJB0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Bhlha9Q5RJB0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bhlha9Q5RJB0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bhlha9Q5RJB0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bhlha9Q5RJB0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bhlha9Q5RJB0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bhlha9Q5RJB0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bhlha9Q5RJB0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bhlha9Q5RJB0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bhlha9Q5RJB0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Bhlha9Q5RJB0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bhlha9Q5RJB0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bhlha9Q5RJB0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bhlha9Q5RJB0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bhlha9Q5RJB0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Bhlha9Q5RJB0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bhlha9Q5RJB0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bhlha9Q5RJB0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bhlha9Q5RJB0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bhlha9Q5RJB0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bhlha9Q5RJB0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bhlha9Q5RJB0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bhlha9Q5RJB0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bhlha9Q5RJB0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bhlha9Q5RJB0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bhlha9Q5RJB0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bhlha9Q5RJB0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bhlha9Q5RJB0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bhlha9Q5RJB0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bhlha9Q5RJB0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bhlha9Q5RJB0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bhlha9Q5RJB0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bhlha9Q5RJB0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bhlha9Q5RJB0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bhlha9Q5RJB0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Bhlha9Q5RJB0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bhlha9Q5RJB0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Bhlha9Q5RJB0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bhlha9Q5RJB0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bhlha9Q5RJB0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bhlha9Q5RJB0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bhlha9Q5RJB0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bhlha9Q5RJB0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bhlha9Q5RJB0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bhlha9Q5RJB0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bhlha9Q5RJB0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bhlha9Q5RJB0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bhlha9Q5RJB0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms